利用人类全基因组SNP芯片筛查2型糖尿病患者大血管病变易感基因的研究

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背景：
　　目前2 型糖尿病的患病率在全球范围内持续上升，而大血管病变是其主要并发症，也是患者致死、致残的主要原因。如何确定大血管病变的易感因素，对易感者尽早采取针对性的防治措施是当前2 型糖尿病研究的重要课题。研究表明，针对传统危险因素的干预措施对某些患者益处不大，血糖、血压、血脂等大血管病变传统危险因素控制良好也不能完全阻止大血管病变的发生，提示一些未知的非传统因素如遗传多态在糖尿病大血管病变的发生中可能起着重要的作用。本研究采用全基因组SNP 芯片对样本DNA 进行扫描分型；并且通过全基因组关联分析，筛选2 型糖尿病早期大血管病变的易感基因和遗传标记，为这一常见复杂疾病的早期个体化风险性预测、早期个体化治疗或预防打下坚实的基础。
　　目的：
　　分析筛查2 型糖尿病病人早期大血管病变的易感基因以及遗传标记，为尽早识别易感者，尽早针对性地予以干预，从而延缓或预防2 型糖尿病患者大血管病变的发生提供有力依据。
　　方法：
　　（1）用高分辨血管外超声法测定颈总、髂总、股动脉的内-中膜厚度（IMT）的方法把前期入组且入组时无大血管病变的进行了干预性治疗的病人分成病例组和对照组。
　　（2）提取病例—对照的血液全基因组DNA，并进行纯化，使其达到芯片检测要求。(3)利用ILLUMINA人类全基因组SNP 芯片(HumanCytoSNP-12 v1.0DNA AnalysisBeadChip Kit)对病例和对照进行全基因组SNP 扫描分型。（4）通过plink 软件对芯片扫描结果全基因组关联分析，筛选2 型糖尿病早期大血管病变的易感基因和遗传标记。
　　结果：
　　通过全基因组关联分析，筛选出在病例组和对照组间有显著差异（p＜0.001）的SNP位点总计452个，其中处于T2DM大血管病变主要代谢通路相关基因内或者附近的SNP位点37个,通过这些SNP 位点锁定T2DM患者大血管病变可能易感基因27个，这些基因分布于导致T2DM大血管病变的8 条主要代谢通路之中。
　　结论：
　　研究结果提示，T2DM大血管病变的发生受遗传多态性影响，通过芯片扫描结果锁定的27个基因可能在其发病的过程中起着重要的作用。

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作者
朱沂;
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作者单位

第三军医大学;

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授予单位第三军医大学;
学科临床检验诊断学
授予学位硕士
导师姓名府伟灵;
年度 2011
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原文格式 PDF
正文语种中文
中图分类糖尿病;
关键词
2型糖尿病; 大血管病变; 单核苷酸多态性; 易感基因; 人类全基因组SNP; 芯片;

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