现场藻华爆发期间东海原甲藻细胞周期定量蛋白质组学研究

声明

摘要

缩略词表

第一章 前言

1．1 海洋甲藻及其藻华概述

1．1．1 甲藻和有害藻华

1．1．2 主要藻华物种

1．1．3 甲藻藻华形成机制

1．2 细胞周期研究概况

1．2．1 细胞周期概述

1．2．2 细胞周期调控的分子机理

1．2．3 甲藻细胞周期调控

1．3 蛋白质组学及其在甲藻细胞周期研究中的应用

1．3．1 蛋白质组学概况

1．3．2 甲藻细胞周期蛋白质组学研究进展

1．4 本文研究目的和内容

第二章 材料与方法

2．1 样品采集

2．2 细胞计数

2．3 流式细胞分析

2．3．1 现场样品预处理

2．3．2 样品测定及分析

2．4 光合色素及营养盐样品采集

2．4．1 光合色素分析

2．4．2 营养盐分析

2．5 蛋白质样品处理与分析

2．5．1 蛋白质提取

2．5．2 还原烷基化

2．5．3 蛋白质定量

2．5．4 SDS电泳

2．5．5 蛋白质酶解与iTRAQ标记

2．5．6 液相分离

2．2．7 蛋白质的液质联用分析

2．2．8 蛋白质生物信息学分析

第三章 藻华现场东海原甲藻细胞周期时相界定及相关参数研究

3．1 结果

3．1．1 藻华现场东海原甲藻细胞周期时相界定

3．1．2 细胞密度变化

3．1．3 细胞色素变化

3．1．4 浮游植物类群表征

3．1．5 营养盐浓度变化

3．2 讨论

3．3 本章小结

第四章 藻华现场东海原甲藻细胞周期定量蛋白质组学研究

4．1 结果

4．1．1 蛋白质鉴定及质谱数据质量控制

4．1．2 蛋白质功能分布

4．1．3 差异表达蛋白质统计和分布

4．1．4 差异表达蛋白质通路富集分析

4．1．5 细胞周期相关蛋白质的鉴定及定量

4．1．6 G1期中期差异表达蛋白

4．2 讨论

4．2．1 Gp-VS-Gm差异表达蛋白KEGG通路富集分析

4．2．2 Gm-VS-Ga差异表达蛋白KEGG通路富集分析

4．2．3 Ga-VS-S差异表达蛋白KEGG通路富集分析

4．2．4 S-VS-M差异表达蛋白KEGG通路富集分析

4．2．5 M-VS-Gp差异表达蛋白KEGG通路富集分析

4．2．6 细胞周期相关蛋白质

4．2．7 不同细胞周期时相重要生物学过程比较(以G1期中期为主)

4．3 本章小结

第五章 结论与展望

5．1 结论

5．2 本论文的特色和创新点

5．3 不足及展望

参考文献

附录

硕士在读期间论文及学术研究情况

致谢