下司犬线粒体DNA及主要组织相容性复合物的遗传多样性研究

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采用PCR（Polymerase Chain Reaction，聚合酶链式反应）扩增和测序方法获得下司犬线粒体DNA的D-loop序列，发现其D-loop5’端高变区Ⅰ582bp碱基序列的A+T含量明显高于G+C含量，表现出强烈的反G偏倚。并于下司犬高变区Ⅰ序列共检测到11个多态位点，构成7种单倍型，单倍型多样性为0.867，说明下司犬线粒体D-loop的单倍型类型丰富，但其高变区Ⅰ的核苷酸多样性（Pi=0.00519）和平均核苷酸差异（k=3.002）却提示，下司犬的遗传多样性较低。聚类分析结果显示，中国家犬有3个母系来源，下司犬与藏獒的亲缘关系最近，建议将藏獒用于下司犬的选育和复壮。
　　家犬的主要组织相容性复合体（Major histocompatibility complex，MHC）又称为犬白细胞抗原（Dog leukocyte antigen，DLA）。本研究利用PCR-SSCP（Single stranded conformation polymorphism，单链构象多态性）技术检测了下司犬等4个品种，46只家犬个体的主要组织相容性复合体DRB1基因第二外显子（DLA-DRB1exon2）的序列变异。目的DNA经SSCP分型后克隆测序，获得270bp的目的基因片段。与已知等位基因比较发现，本文所测序列共有62个多态位点，定义了53个等位基因，其中48个为新发现等位基因。所有序列中都没有发现序列的插入或缺失，经等位基因序列比对发现，非同义替换导致39个氨基酸改变。家犬主要组织相容性复合体DRB1基因第二外显子的非同义替换与同义替换比值（dN/dS）为2.676，说明该基因受正选择作用。数据分析显示，下司犬种群DLA-DRB1exon2具有50个等位基因，与其它家犬品种相比数量最多，而且遗传变异十分丰富，表明下司犬较其它品种具备更强的抗病适应性。

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作者
张嘉伟;
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作者单位

贵州大学;

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授予单位贵州大学;
学科生物化学与分子生物学
授予学位硕士
导师姓名王嘉福;
年度 2009
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原文格式 PDF
正文语种中文
中图分类犬;
关键词
下司犬; 线粒体DNA; 组织相容性复合物; 遗传多样性; 等位基因;

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