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基于GIS技术的隐孢子虫流行病学数据空间分析

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摘要

缩略词表

第一部分 文献综述

1 引言

2 隐孢子虫简介

2.1 隐孢子虫分类

2.2 隐孢子虫生活史

3 全球牛源隐孢子虫流行病学研究现状

3.1 全球牛源隐孢子虫分布

3.2 全球牛源隐孢子虫感染情况

3.3 全球牛源隐孢子虫流行季节

3.4 全球牛隐孢子虫各基因型和基因亚型的分布

4 我国隐孢子虫流行病学研究现状

4.1 我国隐孢子虫分布

4.2 我国隐孢子虫不同宿主感染情况

5 GIS简介

5.1 GIS数据的组织和管理

5.2 GIS的功能

6.1 GIS在疫病研究中的应用简史

6.2 GIS在流行病研究中的应用

7 展望

1 引言

2 材料与方法

2.1 数据来源

2.2 数据处理

2.3 空间定位与表达

3 结果与分析

3.1 描述性统计分析

3.2 空间定位与表达

4 结论与讨论

4.1 本章小结

4.2 本章讨论

1 引言

2 材料与方法

2.1 数据来源

2.2 数据处理

2.3 空间定位与表达

3.1 描述性统计分析

3.2 空间定位与表达

4 结论与讨论

4.1 本章小结

4.2 本章讨论

第四部分 结论与创新点

1 全文总结

2 创新点

3 展望

参考文献

个人简介

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摘要

隐孢子虫(Cryptosporidium)是一种非常重要的具有人兽共患特性的寄生性肠道原虫,主要通过食源或者水源进行传播,可以导致水样腹泻,特别是免疫缺陷患者甚至可能导致死亡。地理信息系统(Geographic Information System,GIS)是一门结合地理学与地图学以及遥感和计算机科学的综合性学科,是一种利用计算机来处理和分析地理信息的工具。伴随着GIS技术的快速发展及在多领域的开发运用,该系统正逐步成为流行病学和公共卫生管理方面重要的技术手段。
  近些年来,针对隐孢子虫流行病学的调查数据呈指数性快速增长,然而如何有效利用这些数据进行分析成为当下的研究热点。
  本论文利用GIS技术结合隐孢子虫流行病学数据进行研究,从全球范围内分析单一宿主(奶牛)隐孢子虫感染情况,以及在中国范围内隐孢子虫感染多种宿主的统计分析,以期展现隐孢子虫感染在时间和空间上的分布规律。
  首先,从全球范围内分析单一宿主(奶牛)孢子虫感染情况。利用关键词“隐孢子虫”、“奶牛”在中国知网CNKI查询中文文献;通过“Cryptosporidium”与“cow”、“cattle”或“calves”作为关键词在PubMed和Web of Science搜索英文文献。查询结果是截止到2016年12月31日出版文献,共搜集到293篇有效文献,通过整理采样时间、采样地点、隐孢子虫感染率、隐孢子虫感染情况等信息利用GIS技术对数据进行可视化处理。结果显示,在全球范围内奶牛源隐孢子虫的平均感染率为17.55%(19278/109841);其中,美洲奶牛隐孢子虫感染率最高,感染率达到28.50% (3674/12892),其次是欧洲20.70%(5078/24535),亚洲的奶牛隐孢子虫感染率最低为13.86%(8009/57801)。奶牛源隐孢子虫种类分布方面,微小隐孢子虫(Cryptosporidium.parvum)在感染类型中占据绝对优势,且在各大洲均有分布且感染率也相对较高,其次是安氏隐孢子虫(C.andersoni)和牛隐孢子虫(C.bovis)在分布和感染率上占据优势。
  其次,在中国范围内对多种宿主的隐孢子虫的感染情况进行统计分析。同样利用关键词“隐孢子虫”在中国知网CNKI搜索中文文献,利用关键词“Cryptosporidium”、“China”在PubMed和Web of Science搜索英文文献。查询结果是截止到2017年12月31日出版文献,共搜集到592篇有效文献,通过整理采样时间、采样地点、隐孢子虫感染率、隐孢子虫感染情况等信息利用GIS技术对数据进行可视化处理。结果显示,我国隐孢子虫的采样地点涉及到除香港特别行政区之外的所有省级行政区。隐孢子虫的宿主统计显示隐孢子虫可以感染哺乳动物、禽类和爬行类等多种类型动物。通过对人、牛、猪和鸡隐孢子虫感染率的统计分析显示,人源隐孢子虫平均感染率为3.28% (6838/208194),人感染隐孢子虫较高的
  地区有新疆、广东、云南和浙江等地;牛源隐孢子虫的平均感染率为14.13% (8024/56795),牛感染隐孢子虫较高的地区主要有浙江、重庆、四川、青海等地;猪源隐孢子虫的平均感染率为17.94% (4971/27712),猪感染隐孢子虫较高的地区有黑龙江和北京;鸡源隐孢子虫的平均感染率为21.10%(2938/13921),鸡感染隐孢子虫较高的地区有四川和安徽等地。
  综上所述,通过本论文的研究发现隐孢子虫的分布基本上不受地理位置的限制,在全球范围内奶牛均有隐孢子虫的感染,在不同地区隐孢子虫的感染类型和感染程度有所不同;然而,在中国不同宿主的隐孢子虫感染种类与感染率各异,在不同地区的分布情况亦有不同。隐孢子虫作为一种重要的人兽共患肠道机会性致病原虫,新的宿主不断被检测,新的种类不断被建立,在全球范围内关于隐孢子虫感染的流行病学数据不断的被更新。目前,GIS空间分析与流行病学的交叉研究尚处于起步阶段,随着时间的推移,将会有越来越多的学者投入到隐孢子虫流行病学的空间分析中,建立更加全面和准确的隐孢子虫流行病学模型。

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