水稻长叶毛基因Hairy Leaf6的图位克隆与功能分析

声明

摘要

缩略词表

1 前言

1．1 研究问题的由来

1．2 表皮毛研究进展

1．2．1 影响表皮毛启动的调控因子

1．2．2 调控表皮毛启始的分子网络

1．2．3 影响表皮毛形态的调控因子

1．2．4 植物激素对表皮毛发育的调控

1．3 生长素调控途径的研究进展

1．3．1 生长素的合成

1．3．2 生长素的运输

1．3．3 生长素的信号途径

1．4 AP2基因研究进展

1．4．1 AP2家族蛋白的特征与分类

1．4．2 AP2蛋白的功能研究

1．4．3 ERF蛋白的功能研究

1．5 水稻表皮毛的遗传研究

1．5．1 水稻光叶基因的研究

1．5．2 水稻长毛基因的研究

1．6 研究目的和意义

2 材料与方法

2．1 研究材料

2．1．1 试验亲本材料

2．1．2 遗传分析的分离群体

2．1．3 研究基因功能的其他材料

2．2 试验方法

2．2．1 田间种植

2．2．2 叶毛表型观察

2．2．3 DNA和RNA的提取

2．2．4 RT-PGR与real-time PCR

2．2．5 标记的开发

2．2．6 引物设计、合成以及测序

2．2．7 全基因组关联分析

2．2．8 载体构建

2．2．9 亚细胞定位

2．2．10 GUS染色和石蜡切片

2．2．11 激素处理

2．2．12 生长素含量测定

2．2．13 酵母杂交

2．2．15 GST Pull Down

2．2．16 凝胶迁移实验(EMSA)

2．2．17 核酸多样性与同源蛋白分析

2．2．18 高温处理与叶片失水速率调查

2．2．19 产量性状考察

2．2．20 数据统计分析

3 结果与分析

3．1 叶毛关联分析与候选基因验证

3．1．1 水稻核心种质的叶毛表型

3．1．2 水稻叶毛表型的全基因组关联分析

3．1．3 候选基因分析与验证

3．2 长毛基因HL6的图位克隆与功能分析

3．2．1 HL6的遗传分析与初定位

3．2．2 HL6的精细定位和候选基因功能验证

3．2．3 HL6的特征分析

3．2．4 HL6的功能研究

3．2．5 HL6参与生长素调控途径

3．3 HL6与OsWOX3B的互作

3．3．1 OsQOX3B调控表皮毛的起始

3．3．2 HL6与OsWOX3B的遗传互作

3．3．3 HL6与OsWOX3B的分子互作

3．3．4 OsWOX3B调控HL6表达

3．3．5 OsWOX3B参与调控生长素途径

3．3．6 HL6-OsWOX3B复合体调控OsYUCCA5表达

3．4 HL6对抗逆和产量的影响

3．5 HL6的基因多样性分析

4 讨论

4．3 HL6与OsWOX3B遗传互作的生物学基础

4．4 OsWOX3B转录调控HL6对表皮毛发育的影响

4．5 HL6与OsWOx3B蛋白互作对表皮毛发育的影响

4．6 HL6对植物生长发育的影响

4．7 GWAS位点与HL6的关系

参考文献

附录

致谢