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第一章 文献综述
1 梨黑星病研究现状
1.1 梨黑星菌病原
1.2 梨黑星菌的产孢及传播
1.3 入侵机制、发病条件和预测预报
1.4 梨黑星病抗性机理的研究
2 植物启动子研究进展
2.1 植物基因启动子的结构特征
2.2 启动子的类型
2.3 启动子的研究方法
3 类受体蛋白(receptor-like protein, RLP)
3.1 类受体蛋白的结构
3.2 类受体蛋白的功能
4 生物信息学在植物抗病研究中的应用
4.1 核酸结构和功能预测
4.2 蛋白质结构和功能预测
5 本研究的目的和意义
第二章 梨抗黑星病基因Hcrp克隆和生物信息学分析
1 前言
2 材料与试剂
2.1 材料
2.2 试验试剂
2.3 主要仪器
3 试验方法
3.1 DNA提取及检测
3.2 RNA提取(CTAB法)
3.3 cDNA第一条链合成
3.4 引物设计
3.5 Hcrp基因同源克隆
3.6 产物回收、克隆及测序
3.7 生物信息学分析
4 结果分析
4.1 Hcrp基因PCR扩增
4.2 ORF预测和系统树分析
4.3 LRR分析
4.4 编码区域预测结果
5 讨论
5.1 Hcrp基因结构分析
5.2 Hcrp基因抗病性分析
5.3 同源序列克隆抗病基因
第三章 Hcrp启动子克隆和生物信息学分析
1 前言
2 材料与试剂
2.1 材料
2.2 试验试剂
3 试验方法
3.1 DNA提取及检测
3.2 Hcrp启动子克隆
3.3 产物回收、克隆及测序
3.4 生物信息学分析
4 结果分析
4.1 同源PCR扩增Hcrp基因启动子
4.2 PCR验证所克隆的启动子
4.3 生物信息学分析所克隆的启动子序列
5 讨论
第四章 类受体蛋白分析
1 前言
2 材料与试剂
2.1 材料
2.2 试验试剂
3 试验方法
3.1 DNA提取及检测
3.2 引物设计
3.3 RLP序列克隆
3.4 产物回收、克隆及测序
3.5 生物信息学分析
4 结果分析
4.1 RLP扩增
4.2 系统进化分析
4.3 序列比对
4.4 组内和组间Ka/Ks(异义替换/同义替换)分析
4.5 核苷酸多样性和Ka/Ks分析
4.6 群体遗传多样性分析
5 讨论
参考文献
致谢