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多器官功能障碍综合征(MODS)患者肠道菌群结构与疾病发生相关性研究

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摘要

多器官功能障碍综合征(multiple organ dysfunction syndrome,MODS)是由多种因素引起的一种疾病,免疫、遗传、细胞凋亡以及肠道菌群结构对其具有重要影响。越来越多的研究发现肠道是MODS发生的原动力,MODS患者肠道中总厌氧菌和益生菌数量减少,而病原菌和机会性致病菌含量上升,而且具有胃肠功能障碍的MODS患者死亡率较高。因此肠道微生物是MODS发生发展及预后的重要影响因素。过去的研究多集中在单个或多个细菌对于MODS的影响,近年来随着高通量分析技术的发展,为探明肠道菌群结构与MODS发生机理提供了可能。该论文采用DGGE和SOLiD高通量测序技术两种分析方法,分别对MODS患者及健康对照肠道菌群结构进行比较分析,以进一步探明MODS发病机制,推动MODS病因的研究,为MODS的临床治疗提供理论依据。
  本研究中,我们收集了15例MODS患者和20例正常对照人群的粪便样本,提取样本细菌总基因组DNA。首先将15例MODS患者按照MODS评分从高到低分成3组,分别为:低分组,L组,6例,MODS评分<5;中分组,M组,5例,MODS评分在5和10之间(包括5分);高分组,H组,4例,MODS评分≥10。然后对细菌总基因组DNA的16S rRNA的V3区进行PCR扩增,进行DGGE图谱及多样性分析,分别分析MODS患者及对照人群肠道菌群的相似性,并通过Shannon-Weaver(H')指数来分析样本的条带数、均匀度指数、多样性指数、丰富度指数和优势度指数。最后挑选了3例MODS患者及3例正常对照组人群共6例样本进行SOLiD高通量测序分析。
  该研究DGGE结果显示,L组及H组与对照组菌群结构差异显著;L组和M组样本肠道菌群结构的种类及数量、优势菌种类及相对含量均有显著差异,L组明显低于M组。M组与H组样本相比,患者肠道菌群结构差异不大,无明显统计学意义。L组与H组相比,H组肠道菌群的种类多但是数量差异不大,优势菌相对含量及种类差异显著。特异条带切胶回收克隆测序发现,MODS患者肠道中,类杆菌属(Bacteroides)、不动杆菌属(Acinetobacter)、肠球菌属(Enterococcus)和大肠杆菌(Escherichia)含量相对较高。SOLiD测序结果显示,3例MODS患者样本中肠道菌群结构体现了个体差异性和多样性,也有一定的相似性,肠球菌属(Enterococcus)含量均为第一。MODS患者与对照组人群的肠道菌群相似性较低,优势菌属差异较大,提示MODS患者肠道中独有的细菌与疾病有关,它们与MODS的关系尚需进一步的探索。

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