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幽门螺杆菌Cag致病岛hp0540基因在其致病机制中的作用

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第一章绪论

1.1研究背景

1.1.1幽门螺杆菌感染的流行病学

1.1.2 H.pylori的致病机制

1.1.3幽门螺杆菌Cag致病岛

1.1.4 Ⅳ型分泌系统(type Ⅳ secretion system,T4SS)

1.2本研究的目的、内容与技术路线

1.2.1研究目的

1.2.2研究内容

1.2.3技术路线

第二章幽门螺杆菌hp0540基因的克隆及序列分析

2.1材料

2.1.1菌株和质粒

2.1.2主要试剂

2.1.3主要溶液的配制

2.1.4主要仪器

2.2方法

2.2.1 H.pylori的培养与鉴定

2.2.2 H.pylori基因组DNA的提取

2.2.3 PCR引物的设计

2.2.4 PCR反应

2.2.5目的DNA片段的回收

2.2.6感受态细胞的制备

2.2.7载体和目的片段的连接

2.2.8转化与筛选

2.2.9重组质粒的鉴定

2.2.10重组质粒中目的基因序列的检测

2.2.11 H.pylori NCTC11637菌株hp0540基因序列提交GenBank

2.2.12 H.pylori hp0540编码蛋白的理化特性及免疫原性预测

2.2.13登陆SMART数据库预测与CagI具有相互作用的蛋白

2.3结果

2.3.1 H.pylori的分离培养与鉴定

2.3.2 PCR法扩增H.pylori hp0540基因片段

2.3.3 TA克隆与鉴定

2.3.4 H.pylori NCTC11637菌株hp0540基因的测序结果

2.3.5 H.pylori菌株间hp0540基因同源性比较

2.3.6 hp0540编码蛋白的理化特性分析

2.3.7 hp0540编码蛋白的免疫表位分析

2.3.8与CagI具有相互作用蛋白的预测

2.4讨论

第三章幽门螺杆菌hp0540基因的原核表达及其抗体制备

3.1材料

3.1.1菌株和质粒

3.1.2主要试剂

3.1.3主要溶液配制

3.1.4主要仪器

3.2方法

3.2.1重组表达质粒的构建

3.2.2目的基因的诱导表达

3.2.3重组蛋白可溶性分析

3.2.4重组蛋白的纯化

3.2.5纯化产物的SDS-PAGE分析

3.2.6重组蛋白的复性、浓缩

3.2.7抗重组CagI蛋白抗体的制备及效价测定

3.3结果

3.3.1重组表达质粒的酶切鉴定

3.3.2不同IPTG浓度对目的蛋白表达的影响

3.3.3不同诱导时间对目的蛋白表达的影响

3.3.4目的蛋白的可溶性分析

3.3.5目的蛋白的纯化、复性及浓缩

3.3.6抗体效价测定

3.4讨论

第四章幽门螺杆菌hp0540基因的缺失及其对CagA蛋白转运能力的影响

4.1材料

4.1.1细胞、菌株与载体

4.1.2主要试剂

4.1.3主要溶液

4.1.4主要仪器

4.2方法

4.2.1细菌和细胞的培养

4.2.2自杀质粒同源片段的扩增

4.2.3自杀质粒pBlueKM402Δhp0540的构建

4.2.4 hp0540基因缺失株的构建

4.2.5 hp0540基因缺失株的鉴定

4.2.6 hp0540的缺失对CagA蛋白转运的影响

4.3结果

4.3.1 hp0540基因缺失自杀质粒的构建

4.3.2 hp0540基因缺失株的鉴定

4.3.3 hp0540基因缺失对CagA蛋白转运能力的影响

4.4讨论

第五章主要结论与展望

5.1主要结论

5.2主要展望

致 谢

参考文献

攻读硕士期间发表论文与参加课题

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摘要

目的:构建幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori)Cag致病岛中hp0540基因的原核表达系统及其缺失株,初步探讨其在CagA转运过程中的作用,为深入研究其在H.pylori致病机制中的作用奠定基础。
   方法:
   1.应用PCR技术从H.pylori11637基因组DNA中扩增hp0540基因片段,克隆至pMD18-2T载体后,进行序列测定,并对其序列进行生物信息学分析;
   2.构建pET-28a-hp0540原核表达载体,转化表达宿主菌BL21DE3;经IPTG诱导表达后,SDS-PAGE法鉴定目的蛋白的表达,并以Ni2+-NTA柱分离纯化目的蛋白;将纯化蛋白免疫新西兰大白兔制备多克隆抗体并测定抗体效价;
   3.利用同源重组原理,设计引物并扩增hp0540基因上下游同源臂片段,构建hp0540基因缺失自杀质粒pBlueKM402△hp0540,电击转化进入幽门螺杆菌,通过抗生素平板进行传代筛选,通过PCR方法验证hp0540基因缺失株H.pylori11637△hp0540的获得;
   4.将hp0540基因缺失株和野生株与正常胃上皮细胞GES-1进行共培养,然后采用Western blot的方法检测H.pylori转运CagA蛋白能力的变化。
   结果:
   1.成功克隆了hp0540基因,全长1086bp(GenBank登录号为HM126476),编码361个氨基酸,与GenBank公布的其他H.pylori菌株基因序列的核苷酸同源性为98%。DNAStar软件预测其编码的蛋白质的相对分子量为39.37kDa,具有较强的免疫原性。
   2.成功构建了pET-28a-hp0540原核表达载体,工程菌经IPTG诱导后,SDS-PAGE显示新生表达蛋白条带,相对分子质量约为39kDa,经Ni2+-NTA柱纯化后可获得重组蛋白,重组蛋白免疫新西兰大白兔后获得效价为1:1.6×105的多克隆抗体。
   3.成功构建了幽门螺杆菌hp0540基因缺失的自杀质粒pBlueKM402△hp0540,并筛选获得了hp0540基因的缺失株。
   4.将野生株与hp0540缺失株分别与正常胃上皮细胞GES-1共培养后,发现hp0540基因缺失株处理组中胃上皮细胞内检测到的CagA蛋白要明显弱于野生株。
   结论:成功构建了hp0540基因的原核表达系统及其缺失株,在与正常胃上皮细胞GES-1的共培养中,hp0540的缺失可以减弱CagA蛋白的转运,它可能是H.pylori负责转运CagA的四型分泌系统(T4SS)的组成成分之一。

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