HIV-1新重组株CRF01_AE/07_BC的鉴定和江苏省CRF01_AE全长序列的特征分析

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第一章 HIV分型以及HIV重组病毒

1.1HIV简介

1.2HIV分型

1.3产生重组病毒的机制

1.4鉴定重组病毒的方法

1.5重组病毒的产生对HIV流行的影响

1.6HIV-1在中国的流行和亚型分布情况

1.7研究目的

1.8研究意义

第二章 HIV-1 CRF01_AE/07_BC新型重组病毒的鉴定

2.1材料与方法

2.1.1仪器试剂

2.1.2样品采集与处理

2.1.3 gag-RT区域测序

2.1.4HIV-1新型重组病毒CRF01_AE/07_BC近全长基因组测序

2.2结果

2.2.1 14条gag-RT序列系统进化分析

2.2.2 14条gag-RT序列RIP分析

2.2.3 07JSNJ001的gag-RT区域重组分析

2.2.4 HIV-1 CRF01_AE/07_BC新型重组病毒重组分析

2.2.5 07JSNJ001十个基因片段的进化分析

2.3讨论

第三章 江苏省HIV-1 CRF01_AE序列分析

3.1材料方法

3.1.1仪器试剂

3.1.2样品采集与处理

3.1.3 07JSWX045的p17和C2V3测序

3.1.4 07JSWX045近全长基因组测序

3.2结果

3.2.1 07JSWX045近全长序列进化分析

3.2.2 07JSWX045近全长序列重组分析

3.2.3 07JSWWX045与HIV-1 CRF01_AE/07_BC的关系

3.2.4 07JSWX045和江苏省男同性恋人群中CRF01_AE的p17和C2V3进化分析

3.2.5 07JSWX045辅助受体预测

3.2.6 07JSWX045耐药性分析

3.3讨论

第四章 结论与展望

4.1结论

4.2展望

参考文献

致谢

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