近全长序列分析HIV-1独特型CRF01_AE/B'重组病毒基因

杨洋; 周磊明; 薛以乐; 潘启超; 康来仪; 戚中田; 钟平

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近全长序列分析HIV-1独特型CRF01_AE/B'重组病毒基因

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目的:对上海市发现的1例独特类型的CRF01_AE/B'重组病毒株进行近全长序列分析,以了解其DNA序列的特征。方法:应用巢式逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法,分段扩增HIV-1近全长基因组相应片段,进行克隆、测序,并分析其遗传进化树和序列断点位置。结果:近全长序列分析提示,该患者所感染的病毒由CRFO1_AE和HIV-1B'亚型嵌合组成,两者各占约50%。其多聚酶蛋白基因(Pol)和外膜糖蛋白基因(Env)区均有HIV-1B'亚型片段和CRFO1_AE片段嵌合组成。2种亚型病毒DNA片段嵌合点的位置与过去报道的重组病毒株(CRF15_AE/B、CRF33_AE/B和CRF34_AE/B)均不同。结论:在我国常见流行的HIV-1 CRF01_AE重组病毒与B'亚型已在HIV-1感染人群中发生重组,其可能是在我国散发流行的独特型重组病毒株。

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来源
《诊断学理论与实践》 |2008年第5期|511-516|共6页
作者
杨洋; 周磊明; 薛以乐; 潘启超; 康来仪; 戚中田; 钟平;
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作者单位

第二军医大学微生物教研室上海市医学生物防护重点实验室;

上海市疾病预防控制中心艾滋病性病科上海市艾滋病研究中心;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类获得性免疫缺陷综合征（AIDS艾滋病）;
关键词
人免疫缺陷病毒I型; 基因亚型; 重组; 近全长序列分析;

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