我国部分地方鸭品种遗传多样性与群体结构分析

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摘要

缩略词说明

第一章 绪论

1 遗传多样性的概念及畜禽遗传资源保护

1．1 遗传多样性的概念

1．2 畜禽遗传资源保护

2 我国地方鸭种起源及品种资源概况

2．1 我国地方鸭种起源与进化

2．2 我国地方鸭种遗传资源概况

2．3 地方鸭品种遗传多样性及群体结构研究进展

2．4 SSR标记及其在家禽遗传育种研究中的应用

2．5 mtDNA的遗传多样性与群体结构分析

2．6 系统发育树构建方法

2．7 本研究的目的与意义

第二章 基于STR分型技术分析我国部分地方鸭品种的遗传多样性与群体结构

1 材料与方法

1．1 样本采集

1．2 SSR引物选择

1．3 主要仪器与试剂

1．4 主要溶液的配制

1．5 鸭基因组总DNA提取

1．6 PCR反应体系及程序的优化

1．7 PCR产物检测

1．8 基于丙烯酰胺凝胶的基因型判定

1．9 荧光引物的筛选与组合

1．10 多色PCR扩增产物ABI-3730XL DNA Analyzer检测

1．11 统计原理与基因型判定方法

1．12 聚类方法

2 结果

2．1 基因组DNA的提取

2．2 普通PCR扩增产物PAGE电泳检测

2．3 筛选的标记引物及其组合

2．4 荧光PCR产物的STR分型

2．5 所选SSR座位的遗传参数

2．6 引物在单个群体中的群体遗传学参数

2．7 F统计量

2．8 单个群体的遗传学参数分析

2．9 遗传距离与其初步应用

2．10 PCA分析

2．11 群体结构分析

3 讨论

3．1 各群体的样本含量

3．2 SSR引物的选择及标记

3．3 群体遗传学参数与遗传距离

3．4 PCA与Structure程序分析

第三章 基于mtDNA D-loop区序列分析我国部分地方鸭品种的遗传结构

1 材料和方法

1．1 实验材料

1．2 实验方法

1．3 统计分析

2 结果与分析

2．1 mtDNA D-loop区扩增效果及测序结果

2．2 鸭mtDNA D-loop区的碱基组成

2．3 鸭mtDNAD-loop区遗传结构

2．4 鸭mtDNA D-loop区遗传多样性

2．5 聚类分析

2．6 Network网络图分析

3 讨论

第四章 基于COI基因序列分析我国部分地方鸭品种的遗传结构

1 材料与方法

1．1 实验材料

1．2 实验方法

1．3 统计分析

2 结果

2．1 COI基因扩增效果及测序结果

2．2 鸭COI基因的碱基组成

2．3 鸭COI基因的遗传多样性

2．4 聚类分析

2．5 Network网络图分析

3 讨论

第五章 巢湖鸭异地小群保种效果监测

1 材料和方法

1．1 实验材料

1．2 实验方法

2 结果与分析

2．1 荧光PCR扩增产物检测分型结果

2．2 保种群体与原产地群体优势等位基因的比较

2．3 保种群体与原产地群体He、PIC的比较

3 讨论

第六章 全文结论

参考文献

附录

致谢

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