蛋白质中氢键以及蛋白质复合物界面检测的核磁共振方法研究

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第一章 绪论

1.1 引言

1.2核磁共振解析蛋白质结构

1.2.1化学位移指认

1.2.2结构约束测定

1.3核磁共振动力学研究

1.4核磁共振研究蛋白质-配体相互作用

1.5核磁共振实验技术的新进展

1.5.1 TROSY和CRINEPT技术

1.5.2残留偶极耦合常数

1.5.3 RD NMR技术

1.6本文研究的主要内容

第二章 发展异核NOESY实验检测蛋白质中氢键

2.1蛋白质中的氢键

2.2核磁共振探测氢键

2.3利用异核NOE检测氢键原理简析

2.4二维异核NOESY实验的发展

2.4.1异核探测二维13C-1H HOESY实验

2.4.21H探测的二维13C-1H HOESY实验

2.5二维异核ROESY实验

2.5.1适用于大分子的异核NOE实验原理分析

2.5.2脉冲序列设计

2.5.3实验结果分析

2.6运用预饱和对HOESY实验灵敏度优化

2.6.1原理分析

2.6.2脉冲序列设计

2.6.3实验结果分析

2.7总结

第三章 亲水性扰动方法检测蛋白质复合物界面

3.1引言

3.2核磁共振研究蛋白质-配体相互作用的方法

3.2.1分子位移扰动(Chemical Shift Perturbation,CSP)

3.2.2分子间NOE(intermolecular NOE)

3.2.3交叉饱和实验(Cross Saturation)

3.2.4分子间转移NOE(Transferred NOE，TrNOE)

3.2.5 WaterLOGSY(water-ligand observed via gradient spectroscopy)

3.3 SEA-HSQC实验研究蛋白质酰胺质子交换速率

3.3.1核磁共振方法研究酰胺质子交换速率

3.3.2 SEA-TROSY实验

3.3.3 Clean SEA-HSQC实验

3.4亲水性扰动方法

3.4.1方法原理

3.4.2实验步骤及数据处理

3.5亲水性扰动方法对Hoxc9和Gem相互作用体系研究

3.5.1 Hoxc9-Gem相互作用体系介绍

3.5.2数据分析及结论

3.6亲水性扰动方法检测钙调蛋白和M13结合界面

3.6.1钙调蛋白和M13蛋白质体系介绍

3.6.2数据分析及结论

3.7总结

参考文献

攻读学位期间学术及科研成果

后记