尼罗罗非鱼Ikaros基因克隆、组织表达及抗无乳链球菌相关SNP位点筛选

声明

引言

第一章 文献综述

1.1 DNA分子标记在水产动物遗传育种中的应用

1.1.1 RFLP在水产动物遗传育种中的应用

1.1.2 RAPD在水产动物遗传育种中的应用

1.1.3 AFLP在水产动物遗传育种中的应用

1.1.4 SSR在水产动物遗传育种中的应用

1.1.5 SNP在水产动物遗传育种中的应用

1.2 SNP分子遗传标记在罗非鱼中应用

1.2.1 罗非鱼生长性状相关的SNP分子遗传标记

1.2.2 罗非鱼抗逆性性状相关的SNP分子遗传标记

1.2.3 罗非鱼性别性状相关的SNP分子遗传标记

1.2.4罗非鱼SNP群体遗传多样性研究及亲缘关系鉴定中的应用

1.2.5 罗非鱼SNPs遗传连锁图谱的构建及QTL定位

1.3 Ikaros基因的研究进展

1.3.1 Ikaros基因的结构

1.3.2 Ikaros基因的表达

1.3.3 Ikaros基因的功能

1.3.4 Ikaros基因多态性与疾病的相关性

1.4 本研究的目的与意义

1.5 本研究的技术路线

第二章 尼罗罗非鱼Ikaros基因的克隆及表达分析

2.1 实验材料

2.1.2 菌株

2.1.3 实验试剂

2.2 实验方法

2.2.1 尼罗罗非鱼Ikaros基因组DNA序列及其cDNA序列的克隆

2.2.2 尼罗罗非鱼Ikaros基因的组织分布

2.2.3 尼罗罗非鱼感染无乳链球菌后Ikaros基因在各组织中的表达变化

2.2.4 生物信息学与统计分析

2.3 实验结果

2.3.1 尼罗罗非鱼Ikaros的cDNA序列及其特征

2.3.2 尼罗罗非鱼Ikaros的基因组DNA序列及其mRNA剪接异构体

2.3.3 尼罗罗非鱼Ikaros蛋白的结构分析

2.3.4尼罗罗非鱼Ikaros的系统进化分析

2.3.5 Ikaros基因在健康尼罗罗非鱼不同组织中的表达特征

2.3.6 感染无乳链球菌后Ikaros基因在尼罗罗非鱼组织中的表达变化情况

2.4 讨论

2.4.1 尼罗罗非鱼Ikaros基因序列特征及分析

2.4.2 尼罗罗非鱼Ikaros同源比较及结构域分析

2.4.3 尼罗罗非鱼Ikaros基因的表达特征

第三章 尼罗罗非鱼Ikaros基因5′调控区的克隆及其与无乳链球菌抗性相关SNP位点的筛选

3.1 实验材料

3.1.1 实验用鱼

3.1.2 菌株

3.1.3 实验试剂

3.2 实验方法

3.2.1 F0和F1代尼罗罗非鱼抗病群体和易感群体的构建

3.2.2 基因组DNA的提取

3.2.5 SNPs的基因分型及与无乳链球菌抗性的关联分析

3.2.6 生物信息学分析

3.3 结果与分析

3.3.2 Ikaros基因5′调控区序列的结构预测和分析

3.3.3 Ikaros基因5?调控区序列SNPs的筛查及与无乳链球菌病抗性的关联分析

3.3.4 F1代尼罗罗非鱼抗病群体和易感群体的SNPs基因分型及遗传结构分析

3.3.5 F1代Ikaros基因5′调控区SNPs的基因分型及遗传结构分析

3.3.6 F1代尼罗罗非鱼SNPs的连锁不平衡分析及与无乳链球菌病抗性的关联分析

3.4 讨论

3.4.1 Ikaros基因5′调控区序列的结构特点

3.4.2 Ikaros基因SNP多态性分析

3.4.3 尼罗罗非鱼抗病相关SNP多态性分析

全文总结

参考文献

硕士期间发表论文情况

致谢