宝钢废气生物处理塔中微生物群落的分子生态学研究

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第1章综述

1.1分子生态技术在环境微生物分析中的应用与研究进展

1.1.1用于环境微生物的分子生态技术

1.1.2电泳分离及显示方法

1.1.3分子生态学技术在环境污染治理研究中的应用

1.2生物信息学的概念和研究内容

1.2.1生物信息学的概念

1.2.2生物信息学研究的内容

第2章研究目的、意义和内容

2.1研究目的和意义

2.2研究内容和技术路线

2.2.1研究内容

2.2.2研究的技术路线

2.3研究方法和仪器

第3章样品总DNA的提取方法

3.1引言

3.2宝钢样品总DNA的抽提方法研究

3.2.1实验材料和方法

3.2.2总DNA样品的常规电泳检验

3.2.3 16S rDNA特定片段的扩增

3.2.4 PCR扩增产物的DGGE分离

3.2.5结论

3.2.6其他样品的分析结果

3.3本章小结

第4章样品的PCR扩增

4.1概述

4.2 PCR原理

4.3 PCR的影响条件及优化

4.3.1模板核酸

4.3.2引物

4.3.3缓冲液

4.3.4 Mg2+

4.3.5三磷酸脱氧核苷酸(dNTP)

4.3.6耐热DNA聚合酶

4.3.7温度循环参数

4.3.8其它因素

4.3.9平台效应(plateau effect)

4.3.10忠实性

4.4 PCR污染的对策[41,42,43]

4.4.1污染的预防

4.4.2污染源的追踪

4.4.3污染的处理

4.5 PCR实验的操作与结果分析

4.5.1实验材料

4.5.2实验步骤和方法

4.5.3实验结果

4.5.4结果讨论

4.6本章小结

第5章样品的DGGE分析

5.1引言

5.2 DGGE原理

5.3 DGGE实验和结果分析

5.3.1实验材料

5.3.2实验方法

5.3.3实验结果分析

5.4本章小结

第6章测序结果的生物信息学分析

6.1引言

6.2生物信息学分析

6.2.1测序结果

6.2.2基于NCBI/Blast软件的核酸序列同源性分析

6.2.3核酸序列之间的多重比对分析及系统进化关系分析

6.3本章小结

第7章结论和建议

7.1结论

7.2建议

参考文献

致 谢