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吐鲁番斗鸡攻击行为的观察及鸡的攻击行为相关基因的SNP分析

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第一章综述

1我国斗鸡的饲养现状及发展前景

1.1我国斗鸡的饲养现状

1.2我国斗鸡的发展前景

2动物攻击行为的研究

2.1动物攻击行为的遗传因素

2.2动物攻击行为的环境因素

2.3遗传与环境在攻击发生发展中的交互作用

3攻击行为相关基因的研究

3.1 5-羟色胺(5-HT)

3.2儿茶酚氧位甲基转移酶(COMT)基因

3.3单胺氧化酶(MAO)

3.4Nr2el(nuclear receptor subfam ily 2,group E,member 1)基因

3.5多巴胺(DA)

4分子遗传标记

4.1 RFLP标记

4.2 RAPD标记

4.3 AFLP标记

4.4微卫星标记

4.5 SNP标记

5研究背景

5.1密码子偏好与基因表达的关系

5.2内含子多态与基因表达的关系

6本实验研究的目的与意义

第二章实验研究

实验一吐鲁番斗鸡攻击行为的初步观察

1材料与方法

2 结果

3讨论与小结

实验二采用PCR-SSCP方法对COMT基因的多态性检测

1材料与方法

2结果分析

3讨论与小结

实验三采用PCR-SSCP方法对MAOA基因的多态性检测

1材料与方法

2结果分析

3讨论与小结

第三章讨论与结论

1选择合适的实验素材

2基因组DNA的制备

3 PCR反应体系

3.1引物的设计和引物浓度

3.2 Mg2+浓度

3.3退火温度

4 PCR-SSCP分析法

结论

参考文献

致谢

作者简介及在学期间发表的文章

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摘要

研究对吐鲁番斗鸡的攻击行为进行了初步的观察分析,并以吐鲁番斗鸡和新罗曼鸡为研究对象,采用PCR-SSCP方法对攻击行为的相关基因COMT和MAOA进行多态分析。 1、选用日龄相近的吐鲁番斗鸡12只,通过两个测试试验对吐鲁番斗鸡的攻击行为进行初步观察分析。 2、采用PCR-SSCP方法对COMT基因的4个外显子进行多态性检测,结果在吐鲁番斗鸡和新罗曼鸡上均未检测到多态。 3、采用PCR-SSCP方法对MAOA基因的10个外显子进行多态性检测,只在引物MAOA1、MAOA2、MAOA5、MAOA7扩增的片段检测到多态,其中MAOA1、MAOA5、MAOA7位点在吐鲁番斗鸡和新罗曼鸡上均检测到多态,MAOA2位点只在吐鲁番斗鸡上检测到多态。测序结果表明,MAOA1扩增片段的AB型在该片段第191bp处出现G→T的突变,在231bp处出现G→A的突变。BB型在该片段第191bp处出现G→T的突变。MAOA2扩增片段的AB型在该片段第137bp处出现T→C的突变。MAOA5扩增片段,AA、AB、AC在207bp处出现T→G的突变;阴、Bc在236bp处出现G→T的突变:BB、CC、BC、AC、AB在244bp处出现T→C的突变;CC、AC、BC在219bp处出现G→A的突变、249bp和230bp处出现G→T的突变;CC、BC在220bp处出现G→A的突变,BB型在154bp出现C→T的突变。上述这些突变位点均未导致氨基酸的改变。经x2适合性检验表明,本研究出现多态性的基因位点,基因频率和基因型频率都符合Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。用x2独立性检验表明,本研究所有出现多态性的基因位点,基因型的构成与品种间有极显著性差异(P<0.01),说明MAOA基因与鸡的攻击行为有一定的联系。

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