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颖壳伯克霍尔德菌基因组分析及水平转移基因的筛选

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摘要

缩略词表

第一章引言

1水稻细菌性穗枯病概述

1.1水稻细菌性穗枯病发病情况

1.2水稻细菌性穗枯病病原菌研究进展

1.3B.glumae的致病因子

2基因水平转移概述

2.1移动元件在HGT过程中的作用

2.2 HGT的检测方法

3研究的目的与意义

第二章B.glumae基因组测序与分析

1实验材料和实验方法

1.1实验材料

1.2仪器

2.1 HN菌株测序

2.2基因组拼接

2.3基因组注释

2.4比较基因组分析

3结果与分析

3.1基因组信息分析

3.2基因组比较分析

4小结与讨论

第三章B.glumae的HGT检测与分析

2.2 HGT候选基因筛选

2.3构建系统发育进化树

3结果与分析

3.1 HN菌株HGT基因分析

3.2 BGR1菌株的HGT基因分析

3.3 LMG2196菌株的HGT基因分析

3.4 AU6208菌株的HGT基因分析

4小结与讨论

总结

参考文献

攻读硕士期间的研究成果

致谢

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