洋葱伯克霍尔德菌复合群部分菌株基于基因组的物种水平重鉴定

周江林; 孔娜; 张琪; 胡明达; 周静; 岳俊杰; 任洪广; 靳远; 梁龙

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洋葱伯克霍尔德菌复合群部分菌株基于基因组的物种水平重鉴定

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cqvip:目的:基于全基因组序列信息分析洋葱伯克霍尔德复合群细菌的分类情况。方法:构建基于recA基因全长序列、7个看家基因片段串联的系统发生树,进行菌株全基因组平均核酸一致性(ANI)值比较,分析各菌株分类情况。结果:获得了recA单基因和7个看家基因片段串联的系统发生树,有5株细菌在系统发生树上的位置与其当前鉴定种的进化分支存在较大差异,全基因组ANI比较显示其与所在进化树分支种的相似性更高。结论:纠正了5株细菌错误的种鉴定,提示公共数据库中该复合群细菌的种鉴定信息需要进一步分析和纠正。

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来源
《生物技术通讯》 |2019年第6期|733-739|共7页
作者
周江林; 孔娜; 张琪; 胡明达; 周静; 岳俊杰; 任洪广; 靳远; 梁龙;
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作者单位

军事科学院军事医学研究院生物工程研究所北京 100071;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类微生物分类学（系统微生物学）;生物信息论;
关键词
洋葱伯克霍尔德复合群; recA; 多位点序列分析; 平均核酸一致性;

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