猪MLH1、KLK7基因的分子鉴定、多态性及产仔数关联分析

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云南地方猪种丰富且独特，是构成云南养猪业重要的种质基础，云南地方猪种产仔数普遍较低，严重制约了云南养猪业的发展。国内外相关研究表明，决定猪产仔数的高低的分子机制异常复杂，涉及到众多基因包括非编码RNA的表达与调控。目前关于云南地方猪种产仔数高低的分子遗传学机制方面的研究取得了一定的进展，主要从候选基因水平即DNA的水平探讨云南地方猪种产仔数高低的遗传机理，本研究以低产仔数的6个云南地方猪种为研究对象，以较高高产仔数的大白猪和长白猪为参照，研究与繁殖相关的两个基因（MutL同源体1，直肠癌,非息肉病性型2（MLH1）基因和激肽释放酶7（KLK7）基因），以探讨这两个基因是否可以作为与猪产仔数相关的候选基因进行后续研究，具体为：
　　1、MutL同源体1，直肠癌，非息肉病性型2（MLH1）是与繁殖相关的重要基因。在本研究中，猪MLH1基因的全长cDNA通过RACE技术被克隆。该基因编码蛋白质具有757个氨基酸残基，和藏羚羊、羊、牛、南方白犀牛、山羊分别具有：96％、95%、93%、92%、92%的高度同源性。这个基因归属于GeneID：100337665。基因进化分析表明猪MLH1基因和南方白犀牛的MLH1基因具有较近的遗传关系。通过PCR-Hha I-RFLP分析发现在该基因mRNA395-bp处具有一个G/A突变(GU373696：c395 G>A)，8个猪种在该突变位点等位基因频率和基因型频率具有很大的差异。该突变多态性和大白猪（n=200）、长白猪（n=200）的产子数进行关联分析表明该突变与总产子数关联极显著（P＜0.01）。因此，猪MLH1基因可以作为猪产子数候选基因以来提高猪产子数。本实验研究结果为猪MLH1基因的进一步研究奠定了基础。
　　2、激肽释放酶7（Kallikrein-related peptidase7，KLK7）是另外一个与繁殖相关的重要基因。在本研究中，通过RT-PCR技术，克隆猪KLK7基因的全长编码序列。该基因的序列分析表明，猪KLK7基因编码含有257个氨基酸的蛋白质，该蛋白质与6种生物KLK7蛋白具有高度同源性：北极熊（95%）、威德尔海豹（94%）、狗（92%）、太平洋海象（95%）、家猫（92%）、东北虎（91%）具有高度同源性。通过计算机辅助分析表明该基因结构有5个外显子和4个内含子。基因进化分析表明，猪KLK7基因和狗的KLK7基因具有较近的亲源关系。通过PCR-Alu I-RFLP分析发现在该基因mRNA390-bp处具有一个T/C突变（GU373714：c390 T>C），8个猪种在该突变位点等位基因频率和基因型频率具有很大的差异。该突变位点的多态性与大白猪（n=200）、长白猪（n=200）的产仔数进行关联分析，结果表明该突变位点与猪总产仔数关联显著差异（P＜0.05）。因此，猪KLK7基因可以作为猪产仔数候选基因用来提高猪产仔数。本实验研究结果为猪KLK7基因的进一步研究奠定了基础。

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作者
杨德明;
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作者单位

云南农业大学;

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授予单位云南农业大学;
学科动物营养与饲料科学
授予学位硕士
导师姓名刘永刚;
年度 2017
页码
总页数
原文格式 PDF
正文语种中文
中图分类猪;
关键词
肉猪; 繁殖性状; 分子鉴定; 激肽释放酶7; 非息肉病性型2; 基因多态性;

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