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龙眼体细胞胚胎发生早期AGO基因家族的全基因组鉴定、表达与功能分析

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第一章 引言

1 植物AGO蛋白研究进展

1.1 植物AGO蛋白的结构研究

1.2 AGO蛋白参与植物microRNA(miRNA)的生物合成

1.3 植物AGO蛋白的功能研究

1.4 AGO蛋白的分类研究

2 植物体胚发生研究进展

2.1 植物激素对体胚发育的影响

2.2 植物体胚发生过程的基因表达调控

2.3 植物体胚发生过程的转录组学研究

3 龙眼体胚发生的研究进展

3.1 龙眼体胚发生与植株再生

3.2 龙眼体胚发生过程的生理生化研究

3.3 龙眼体胚发生相关基因的克隆及表达分析

4 植物DNA甲基化的研究进展

4.1 DNA甲基化概述及DNA甲基化的维持

4.2 植物中DNA甲基化的特征及分布

4.3 RNA介导的DNA甲基化途径

4.4 植物DNA甲基化的作用

5 植物启动子的研究进展

5.1 植物启动子克隆技术的研究

5.2 植物启动子功能分析方法

6 本研究的意义及主要内容

6.1 研究意义

6.2 本研究的主要内容

第二章 龙眼体胚发生早期AGO家族的全基因组鉴定、生物信息学分析及DlAGO4、DlAGO7、DlAGO10和DlAGOMEL1 cDNA的克隆

第一节 龙眼体胚发生早期AGO家族的全基因组鉴定和生物信息学分析

1 材料与方法

2 结果与分析

3 讨论

第二节 龙眼EC中DlAGO4、DlAGO7、DlAGO10和DlAGOMEL1 cDNA全长的克隆

1 材料与方法

2 结果与分析

3 讨论

第三章 龙眼DlAGOs启动子的克隆和生物信息学分析

1 材料与方法

1.1 材料

1.2 方法

2 结果与分析

2.1 龙眼DlAGOs启动子序列的克隆

2.2 龙眼DlAGOs启动子CpG岛的预测

2.3 龙眼DlAGOs启动子转录起始位点和核心启动子区域的预测

2.4 龙眼DlAGOs启动子功能元件分析

3 讨论

3.1 龙眼DlAGOs可能参与激素信号转导

3.2 龙眼DlAGOs可能参与不同逆境及其它响应调控

3.3龙眼DlAGOs启动子“CpG”岛的潜在功能

第四章 龙眼DlAGOs家族的表达模式分析

1 材料与方法

1.1 材料

1.2 方法

2 结果与分析

2.1 DlAGOs家族在龙眼体胚发生早期阶段的表达分析

2.2 DlAGOs家族在龙眼合子胚发育过程中的表达分析

2.3 DlAGOs家族在龙眼不同组织部位的特异性表达分析

2.4 不同激素处理下DlAGOs家族的表达分析

2.5 非生物胁迫处理下DlAGOs家族的表达模式分析

3 讨论

3.1 DlAGOs在龙眼体胚与合子胚发育可能发挥相同的作用

3.2 DlAGOs可能参与调控龙眼胚胎发生发育过程

3.3 DlAGOs可能参与龙眼种子、叶片和花器官的发育

3.4 DlAGOs可能响应多种激素的应答

3.5 DlAGOs可能参与非生物胁迫应答机制

第五章 龙眼DlAGOs启动子的功能验证

1 材料与方法

1.1 材料

1.2 主要载体和试剂

1.3 试验方法

2 结果与分析

2.1 DlAGOs启动子表达载体的构建

2.2 瞬时转化烟草叶片的GUS组织化学染色

2.3 DlAGOs启动子转化烟草叶片驱动GUS基因表达的定量分析

2.4 不同激素处理下转化烟草叶片的GUS活性测定

2.5 DlAGOs启动子转化龙眼EC驱动GUS基因表达的定量分析

3讨论

3.1 高等植物启动子的基本结构和作用

3.2 龙眼DlAGOs可能参与激素调控

3.3龙眼遗传转化体系的研究

第六章 DlAGO7、DlAGO10和DlAGOMEL1的亚细胞定位研究

1 材料与方法

1.1 材料

1.2 菌种和载体

1.3 主要试剂

1.4 试验方法

2 结果与分析

2.1 龙眼AGO蛋白信号肽和亚细胞定位预测分析

2.2 DlAGO7、DlAGO10和DlAGOMEL1亚细胞定位融合表达载体的构建

2.3 DlAGO7、DlAGO10和DlAGOMEL1的亚细胞定位

3 讨论

3.1 亚细胞定位的研究进展

3.2 AGO蛋白在植物细胞中亚细胞定位的研究进展

第七章 5-氮胞苷对龙眼体胚发生早期及DlAGOs表达的影响

1 材料与方法

1.1 材料

1.2 方法

2 结果与分析

2.1 5-azac与2,4-D处理对龙眼早期体胚发生和DlAGOs表达的影响

2.2 低浓度5-azac对龙眼体胚发生的影响和DlAGOs的表达模式分析

3 讨论

3.1 DNA甲基化水平对龙眼体胚发生的影响

3.2 2,4-D与5-azac处理对植物体胚发生的影响

3.3 龙眼AGO基因可能参与DNA甲基化机制

第八章 5-氮胞苷处理下龙眼体胚发生早期的转录组学分析

1 材料与方法

1.1 材料

1.2 总RNA的提取、cDNA文库构建与高通量测序

1.3 测序数据的生物信息学分析

2 结果与分析

2.1 转录组测序数据分析

2.2 基因表达量水平的分析和差异表达基因的筛选

2.3 转录因子及植物抗病基因结构域分析

2.4 差异表达基因的功能富集分析

2.5 5-azac处理下丁酸盐代谢途径相关基因差异表达分析

2.6 5-azac处理下硫代谢途径相关基因差异表达分析

2.7 5-azac处理下硒代化合物代谢途径相关基因的差异表达分析

2.8 5-azac处理下龙眼体胚发生早期差异表达基因的qPCR验证

3 讨论

3.1 DlAGO4基因在龙眼体胚发生早期的作用

3.2 DNA甲基化水平降低促进龙眼体胚发生相关基因的表达

3.3 丁酸盐代谢对植物体胚发育的影响

3.4 硫代谢对龙眼体胚发生早期的重要作用

第九章 结论与展望

附录

攻读博士期间发表论文

致谢

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著录项

  • 作者

    陈荣珠;

  • 作者单位

    福建农林大学;

  • 授予单位 福建农林大学;
  • 学科 园艺学;果树学
  • 授予学位 博士
  • 导师姓名 赖钟雄;
  • 年度 2020
  • 页码
  • 总页数
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 S85S82;
  • 关键词

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