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摘要
缩略词
第一章绪论
1.1海洋沉积物中的微生物群落结构
1.1.1海洋沉积物概况
1.1.2海洋沉积物中微生物群落结构
1.2伍斯氏菌科
1.2.1伍斯氏菌科的建立
1.2.2伍斯氏菌科在全球海洋沉积物中的分布
1.2.3Woeseiaceae/JTB255类群在碳氮硫循环中的作用
1.3微生物培养技术研究进展
1.3.1调整培养基和培养条件
1.3.2群体培养
1.3.3细胞捕获
1.3.4高通量培养
1.4立题依据
第二章伍斯氏菌在环境中的分布及基因组分析
2.1实验材料及方法
2.1.1样品采集
2.1.2沉积物及上覆水样品微生物群落结构
2.1.3伍斯氏菌基因组分析
2.2实验结果及分析
2.2.1样本测序数据统计
2.2.2沉积物及上覆水样品微生物群落结构
2.2.3伍斯氏菌基因组分析
2.3小结
第三章伍斯氏菌的分离培养
3.1实验材料
3.1.1实验样品
3.1.2培养基和实验试剂
3.1.3实验仪器
3.2实验方法
3.2.1样品的稀释涂布培养
3.2.2细菌的分离纯化及保藏
3.2.3基于16s rDNA测序的细菌鉴定
3.2.4伍斯氏菌科系统发育树的构建
3.3实验结果
3.3.1菌株的分离及分类
3.3.2分离得到的伍斯氏菌的分类地位
3.4小结
第四章四株伍斯氏菌的基因组分析
4.1实验材料及方法
4.1.1实验菌株
4.1.2实验试剂和仪器
4.1.3实验方法
4.2实验结果
4.2.1基因组基本特征
4.2.2基因组成分分析
4.2.3基因组功能分析
4.2.4 4株伍斯氏菌的比较基因组分析
4.3小结
第五章三株新菌的多相分类
5.1实验材料
5.1.1实验菌株
5.1.2培养基和试剂
5.1.3实验仪器
5.2实验方法
5.2.1分子遗传学鉴定
5.2.2菌株的形态特征分析及菌株保藏
5.2.3菌株的生理生化特征分析
5.2.4菌株的化学成分分析
5.3实验结果及分析
5.3.1红色海滑菌(Marinilabilia rubra)WTE16T多相分类
5.3.2美丽简纳西氏菌(Jannaschia formosa)12N15T多相分类
5.3.3蜜蜡色黄杆菌(Flavobacterium cerium)1E403T多相分类
5.4小结
第六章总结与展望
6.1总结
6.2展望
参考文献
附录
致谢
资助情况
攻读学位期间发表和撰写的学术论文目录
山东大学;