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酵母中的分子伴侣蛋白SIS1的C末端CSIS1和另一种分子伴侣蛋白Ssa1的LID结构区域之间的功能和结构模型的研究

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目录

摘要

Abstract

第一章文献综述

第二章实验材料与方法

第一节实验材料

第二节实验方法

1.表达纯化SIS 1,Ssal的PBD片段及LID片段蛋白

2.CSIS1与Ssa1的LID及PBD蛋白之间的pull-down实验

3.CSIS 1和HSP70的LID片段结合的复合物

4.CSIS 1和HSP70的PBD片段结合产物

5.HSP70的LID片段降解产物的N端氨基酸序列测定

6.克隆,表达LID片段的删除突变片段(LID△G)

7.生长CSIS-LID复合物晶体

8.生长CSIS 1-LID△G复合物的晶体

9.克隆表达selenomethionine-SISl和selenomethionine-LID蛋白

10.生长Se-CSIS 1和Se-LID复合物晶体

11.利用ITC(微热测量仪)测定HSP70C末端4,7,15,26氨基酸与CSIS1之间的相互作用

12.生长CSIS与HSP70 C末端4 (L4),15(l15),26(l26)氨基酸复合物晶体

13.利用AFM直接观察CSIS 1,LID,CSIS 1-LID蛋白质分子构象

14.X-ray对各种复合物晶体的衍射

第三章实验结果

1.SISI蛋白的表达量约为80-100mg/1升LB培养基

2.Ssa1的LID和PBD蛋白的表达和前述的SIS1蛋白大致相同

3.CSIS 1,LID,PBD蛋白间的pull-down实验

4.既然pull-down实验说明CSIS1很可能和LID及PBD的蛋白结合,下一步就是设法得到CSIS1和LID蛋白复合物及CSIS1和PBD蛋白复合物

5.生长CSIS1-LID复合物的晶体前,先用Hampton公司的晶体生长条件的筛选试剂合(I和II)筛选可能的晶体生长条件

6.质谱显示的小分子量蛋白是来自LID蛋白的降解产物,为了确定它在LID的位置,首先将已经降解的CSISL-LID进行SDS蛋白电泳,显示LID降解出一条约10KD左右的片断

7.接近LIDC末端约35-16个氨基酸处

8.为了确定这些LIDC末端的肽段到底是否和CSIS1结合,我们还利用ITC(微热测量仪)进行研究

9.为了直观地观察溶液CSIS-LID复合物的结合情况,我们利用AFM在(原子力显微镜)观测,AFM理论上可达到纳米级分辨率

10.CSIS1-LID复合物晶体被带到同步辐射加速器,利用X-ray源进行衍射并收集数据

第四章讨论

1.CSIS 1和LID的结合

2.CSIS1不但和LID结合,而且LID末端的8-15个氨基酸是结合的位置所在

3.CSIS 1和LID及LID突变体,LID末端氨基酸结合的复合物晶体情况

4.从AFM的结果认识CSIS 1和LID的结合

第五章总结

图表

参考文献

致谢

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摘要

该篇论文首次报导酵母S.cerevisiae中的HSP40同源蛋白SIS1和HSP70同源蛋白Ssa1之间的复合物模型的研究,对于研究分子伴侣蛋白HSP40/HSP70复合物的功能模型有指导意义.SIS1蛋白质由N端的J-结构区和C端的PBD-结构区(肽结合区域)组成;Ssa1蛋白质由N端的ATPase-结构区(结合并水解ATP的区域)和C端的PBD-结构区(肽结合区域),其中包括LID-结构区(盖子区域)组成.SIS1本身是二聚体结构,两个SIS1单体通过其PBD-结构区的C末端相连形成大沟.根据SIS1的结构显示,每个SIS1的PBD-结构区上有一个疏水的肽结合区,可以结合未成熟或没有正常折叠的呈延展状态的肽段.

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