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Compartmental modeling framework for investigating pathway-based statistical methodology and study design in candidate gene association studies.

机译:间隔建模框架,用于研究候选基因关联研究中基于途径的统计方法和研究设计。

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摘要

Many statistical methods have been introduced for candidate gene association study of complex diseases. However, these methods typically used a simple penetrance function linking genetic variation to phenotype without incorporating detailed biologic information. We developed a physiologically based compartmental model (CM) to simulate glucose and insulin profiles following oral glucose tolerance test, in which each model parameter directly links to a specific biologic function. Then, "genes" can be assigned to model parameters to simulate specific genetic defects in the glucoregulatory system. Through simulations, we demonstrate that CM provides helpful information for study designs and pathway-based statistical analysis. This application represents a unique combination of statistical genetic and compartment modeling methodology, and provides an excellent simulation tool for novel statistical genetic methods to untangle the genetic architecture of complex diseases.
机译:已经引入了许多统计方法来进行复杂疾病的候选基因关联研究。然而,这些方法通常使用简单的外显功能,将遗传变异与表型联系起来,而没有纳入详细的生物学信息。我们开发了一种基于生理的隔室模型(CM),可以在口服葡萄糖耐量测试后模拟葡萄糖和胰岛素谱,其中每个模型参数都直接链接到特定的生物学功能。然后,可以将“基因”分配给模型参数,以模拟糖调节系统中的特定遗传缺陷。通过仿真,我们证明了CM为研究设计和基于途径的统计分析提供了有用的信息。该应用程序代表了统计遗传学和区室建模方法的独特结合,并为新型统计遗传学方法提供了一种出色的模拟工具,以解开复杂疾病的遗传结构。

著录项

  • 作者

    Guan, Zhixin.;

  • 作者单位

    University of Southern California.;

  • 授予单位 University of Southern California.;
  • 学科 Biology Biostatistics.; Health Sciences Public Health.
  • 学位 M.S.
  • 年度 2005
  • 页码 48 p.
  • 总页数 48
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 eng
  • 中图分类 生物数学方法;预防医学、卫生学;
  • 关键词

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