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Phylogenetic analyses of the Caulerpales (Ulvophyceae, Chlorophyta) based on RUBISCO large subunit gene sequences.

机译：基于RUBISCO大亚基基因序列的Caulerpales（Ulvophyceae，Chlorophyta）的系统发育分析。

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In a review of caulerpalean taxonomy, Hillis-Colinvaux recognized two suborders, the Bryopsidineae and Halimedineae. Phylogenetic analyses based on 18S rRNA sequence data supported the hypothesis of two monophyletic suborders within the Caulerpales. However, analyses of morphological characters inferred monophyly in only the Halimedineae. These results prompted the current reanalysis of this diverse group of green algae based on plastid encoded RUBISCO large subunit (rbcL) gene sequences. Thirty-two caulerpalean ingroup taxa were analyzed via maximum parsimony (MP), maximum likelihood (ML) and Bayesian inference (BI). Results of all analyses suggest that the Halimedineae and Bryopsidineae form separate monophyletic assemblages. The phylogenetic position of taxa with uncertain affinity, such as Dichotomosiphon tuberoses and Pseudocodium floridanum were also resolved with rbcL sequence data. Molecular evolutionary analyses detected no evidence of positive selection for the rbcL gene among caulerpalean taxa.
机译：在对caulerpalean分类法的评论中，Hillis-Colinvaux识别了两个亚目：Bryopsidineae和Halimedineae。基于18S rRNA序列数据的系统发育分析支持Caulerpales中两个单系统亚序列的假说。但是，仅哈利麦地那一类的形态特征分析就可以推断出来。这些结果促使当前基于质体编码的RUBISCO大亚基（rbcL）基因序列重新分析这组不同的绿藻。通过最大简约度（MP），最大似然度（ML）和贝叶斯推断（BI）分析了三十二个caulerpalean组内分类单元。所有分析的结果表明，哈利木碱科和核苷科形成了单独的单系组合。还使用rbcL序列数据解析了亲和力不确定的类群的系统发育位置，例如双歧管晚香玉和佛罗里达假单胞菌。分子进化分析未发现在caulerpalean分类群中rbcL基因有阳性选择的证据。

著录项

  • 作者

    Lam, Daryl.;

  • 作者单位

    California State University, Fresno.;

  • 授予单位 California State University, Fresno.;
  • 学科 Biology Botany.; Biology Genetics.
  • 学位 M.S.
  • 年度 2005
  • 页码 37 p.
  • 总页数 37
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 eng
  • 中图分类 植物学;遗传学;
  • 关键词

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