基于转录组测序的枇杷腋芽成花相关基因的筛选

章加应; 肖海涛; 张学英; 安海山; 徐芳杰; 周博强

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基于转录组测序的枇杷腋芽成花相关基因的筛选

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以枇杷品系春花(具有腋芽成花特性)和品种‘火炬’(不具有腋芽成花特性)为试验材料,利用RNA-seq技术对枇杷腋芽进行转录组测序,以期筛选出调控枇杷腋芽成花的关键基因。结果表明:共鉴定到66 197条差异表达基因,其中上调表达基因主要集中在2月27日—4月8日;维恩图分析显示,不同取样点共同上调表达的基因有160个,共同下调表达的基因有198个。差异表达基因GO功能注释到3个大类(生物过程、细胞组分和分子功能)的48个功能组,KEGG通路显著性富集分析表明,差异基因主要被注释到20个途径上,富集于植物激素信号传导、淀粉和糖代谢、苯基丙烷代谢、植物-病原体互作反应和谷胱甘肽代谢等途径。经功能注释后,最终从腋芽转录组筛选到32个成花基因、1个ABA受体基因PYL4、1个ABA脱氢酶基因ABH4和大量功能未知的新基因,这些基因可能在枇杷腋芽成花途径中起重要作用。本研究有助于更好地了解枇杷腋芽成花过程中的基因转录水平,也可为进一步解析枇杷腋芽成花的分子遗传机制奠定基础。

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来源
《上海农业学报》 |2022年第6期|47-57|共11页
作者
章加应; 肖海涛; 张学英; 安海山; 徐芳杰; 周博强;
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作者单位

上海市农业科学院林木果树研究所;

上海应用技术大学生态技术与工程学院;

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正文语种 chi
中图分类枇杷;
关键词
枇杷; 腋芽成花; 转录组分析;

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