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猪流行性腹泻病毒流行株M基因的克隆与序列分析

         
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摘要

The M genes of 2 clinical isolates of porcine epidemic diarrhea virus(PEDV),D1 and D3 were cloned by RT-PCR,then their nucleotide and encoding amino acid sequences were analyzed.The results showed that the nucleotide sequence homology of the 2 isolates was 98.1％ and the homology of amino acid sequence was 97.8％.The phylogenetic relationship of the isolate D1 and the reference strain EAS1,SM98,CHM2013 isolates were relatively close,while the phylogenetic relationship of the isolate D3 and PEDV-LY,PEDV-WS,CH22 isolates were relatively close.Compared with the reference strain CV777,the location and sequence composition of 4 antigen determinants in M protein of isolate D1 were changed.%采用RT-PCR方法对收集的2株猪流行性腹泻病毒(PEDV)临床毒株(D1、D3)的M基因进行克隆,并对其核苷酸和推导的氨基酸序列进行分析.结果表明:2株PEDV流行毒株M基因间核苷酸序列同源性为98.1％,氨基酸序列同源性为97.8％.流行毒株D1与参考株EAS1、SM98、CHM2013分离株亲缘性较近,流行毒株D3与参考株PEDV-LY、PEDV-WS、CH22分离株亲缘性较近.与参考株CV777相比,D1株M蛋白有4个抗原决定簇的位置和序列组成发生了变化.

著录项

  • 来源
    《上海农业学报》 |2018年第1期|79-83|共5页
  • 作者

    丁卫星; 王荣谈; 李春华; 夏叶; 郭佳宏; 倪建平; 缪德年; 赵敏;

  • 作者单位

    上海瑞丰农业科技有限公司,上海201106;

    上海瑞丰农业科技有限公司,上海201106;

    上海瑞丰农业科技有限公司,上海201106;

    上海市农业科学院上海种猪工程技术研究中心,上海201106;

    上海市农业科学院上海种猪工程技术研究中心,上海201106;

    上海市农业科学院畜牧兽医研究所,上海201106;

    上海佳牧生物制品有限公司,上海201106;

    上海市农业科学院上海种猪工程技术研究中心,上海201106;

    上海市农业科学院畜牧兽医研究所,上海201106;

    上海市农业科学院畜牧兽医研究所,上海201106;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 家畜病毒学;
  • 关键词

    猪流行性腹泻病毒; 流行毒株; M基因;

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