萝卜ALMT基因家族的鉴定与表达

刘同金; 徐铭婕; 汪精磊; 刘良峰; 崔群香; 包崇来; 王长义

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萝卜ALMT基因家族的鉴定与表达

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为探究萝卜铝激活苹果酸转运蛋白(ALMT)家族成员对生物和非生物胁迫的响应,本研究通过生物信息学方法对萝卜ALMT家族成员进行鉴定,并利用转录组数据对其进行表达分析。结果显示,萝卜基因组中包含17个ALMT基因,分布于8条染色体。该家族成员外显子数量为5~7个,预测N-端含有5~6个跨膜结构,在染色体上的分布不均匀。萝卜ALMT基因家族成员启动子上有多种激素响应、胁迫响应、组织和器官生长发育与环境响应的顺式作用元件,表明萝卜ALMT基因家族成员的表达受多种条件的调控。对它们在不同组织和发育时期,以及对Agrobacterium tumefaciens的侵染和重金属(铅、镉和铬)胁迫的响应研究发现,RsALMT1和RsALMT13可能参与抵抗A.tumefaciens的侵染;RsALMT3可能调控叶片气孔的开放,而RsALMT7、RsALMT11和RsALMT14可能调控叶片气孔的关闭;RsALMT15可能参与绿肉萝卜根肉中叶绿素的积累;RsALMT16在抵御铅胁迫过程中发挥重要作用。以上结果将为进一步研究萝卜ALMT家族成员在生物和非生物胁迫响应中的功能与分子机制奠定基础。

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来源
《浙江农业学报》 |2022年第4期|746-755|共10页
作者
刘同金; 徐铭婕; 汪精磊; 刘良峰; 崔群香; 包崇来; 王长义;
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作者单位

金陵科技学院园艺园林学院;

浙江省农业科学院蔬菜研究所;

江宁区农业农村局;

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正文语种 chi
中图分类萝卜;
关键词
萝卜; ALMT基因家族; 系统进化; 基因表达;

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