基于BSA-seq法的油菜野芥胞质雄性不育恢复基因的分析

尹明智; 胡燕

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基于BSA-seq法的油菜野芥胞质雄性不育恢复基因的分析

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细胞质雄性不育是利用杂种优势创制油菜杂交种的重要途径之一.而恢复系的选育及恢复基因的研究有利于提高细胞质雄性不育系的应用价值.该研究以甘蓝型油菜细胞质雄性不育系1193A和恢复系15-R1为亲本,以F2群体构建了2个极端性状混池,采用BSA-seq技术方法,对恢复基因进行定位分析.结果表明:(1)不育系1193A与恢复系15-R1之间共获得非同义突变的SNPs共33 883个,混池间共有7 996个非同义编码突变.(2)InDel检测与注释结果表明,亲本间引起移码突变的有2 918个,混池间引起移码突变的有840个.(3)综合SNP和InDel的关联分析结果,将恢复基因定位于C09染色体上的0～880000区域,总长度为880 kb.(4)对候选区域的SNP和InDel注释发现,亲本间存在非同义突变的SNP共40个,混池间存在非同义突变的SNP共65个,亲本间存在移码突变的InDel共7个,混池间存在移码突变的InDel共儿个;对候选区间内的编码基因进行注释,结果共注释到162个基因,其中存在非同义突变基因11个,移码突变基因5个,这些基因可能与育性恢复有关.

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来源
《西北植物学报》 |2020年第7期|1148-1156|共9页
作者
尹明智; 胡燕;
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作者单位

遵义师范学院生物与农业科技学院贵州遵义563006;

遵义师范学院生物与农业科技学院贵州遵义563006;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类基因工程的应用;
关键词
油菜; 野芥细胞质雄性不育; 恢复基因; 基因组测序; BSA法;

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