不同因素对六盘山地区甘肃鼢鼠肠道细菌多样性的影响

杨静; 南小宁; 邹垚; 张斐然; 石建宁; 韩崇选

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不同因素对六盘山地区甘肃鼢鼠肠道细菌多样性的影响

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[目的]研究甘肃鼢鼠肠道细菌的群落结构和多样性,探讨不同环境因素对六盘山地区甘肃鼢鼠肠道细菌多样性的影响.[方法]通过Illumina高通量测序技术,对甘肃鼢鼠的36个盲肠样品进行16SrRNA V3-V4区的高通量测序,分析了肠道细菌多样性、丰度和群落结构,探讨地域、性别和季节等因素对甘肃鼢鼠肠道细菌多样性的影响.[结果]甘肃鼢鼠肠道细菌群落主要包括3个门,其中Firmicutes 门占主导地位,其次是Bacteroidetes和Proteobacteri.在属水平,优势菌属分别为Oscillospira、Ruminococcus、Coprococcus和Desulfovibrio等.不同县(区)样品中,彭阳县、隆德县和泾源县三个县的甘肃鼢鼠肠道细菌菌群结构相似度较高,海原县甘肃鼢鼠肠道细菌群落结构在组内相似度高,与其他县(区)相似度低;雌性甘肃鼢鼠肠道细菌群落结构相似性高,而雄性细菌群落结构在样品间差异较大;甘肃鼢鼠肠道细菌菌群多样性秋季显著高于春季,细菌群落结构相似度秋季高于春季.[结论]不同地域、性别和季节因素对甘肃鼢鼠肠道细菌群落结构产生显著的影响,甘肃鼢鼠肠道细菌群落结构和多样性的变化对基于食源的季节性变化具有积极的响应.

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来源
《微生物学报》 |2018年第8期|1382-1396|共15页
作者
杨静; 南小宁; 邹垚; 张斐然; 石建宁; 韩崇选;
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作者单位

西北农林科技大学林学院,陕西杨陵712100;

西北农林科技大学林学院,陕西杨陵712100;

西北农林科技大学林学院,陕西杨陵712100;

西北农林科技大学林学院,陕西杨陵712100;

宁夏森林病虫害防治检疫总站,宁夏银川 750001;

西北农林科技大学林学院,陕西杨陵712100;

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正文语种 chi
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关键词
甘肃鼢鼠; 肠道菌群; 高通量测序; 盲肠;

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