核糖体RNA测序技术在海洋微生物多样性研究中的应用

刘宇航; 陈松泽; 张传伦; 范陆

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核糖体RNA测序技术在海洋微生物多样性研究中的应用

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海洋微生物总数高达1030个,在海洋生态系统中发挥着驱动能量物质循环和维持生态平衡的重要作用.深入研究海洋微生物多样性有助于理解海洋生态系统运行机理、应对全球海洋生态危机,以及开发海洋微生物资源.由于目前可培养分离的海洋微生物种类极少,极大限制了对海洋微生物群落、丰度和生理生态特征的研究.核糖体RNA测序技术以较低的成本,根据遗传信息差异对微生物快速准确地进行分类鉴定,揭示群落结构、评估进化和生态学关系.近年来基于核糖体RNA序列测序分析的海洋微生物学研究随着测序技术本身的快速优化,在发现海洋微生物新类群,揭示海洋微生物生态规律,分析海洋微生物进化关系,以及与海洋微生物相关的代谢产物开发和海洋生态治理等研究中取得显著进展.本综述详细介绍了核糖体RNA序列测序技术的原理,各代测序技术在海洋微生物多样性研究中的应用,以及多种建库和测序技术的有机结合.最后对研究不同海洋微生物多样性问题提供了测序方案的建议和展望,以期为核糖体RNA测序技术在海洋微生物多样性研究中的应用提供参考.

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来源
《微生物学报》 |2020年第9期|1751-1771|共21页
作者
刘宇航; 陈松泽; 张传伦; 范陆;
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作者单位

南方科技大学海洋科学与工程系深圳海洋地球古菌组学重点实验室广东深圳518055;

哈尔滨工业大学环境学院黑龙江哈尔滨150001;

同济大学海洋地质国家重点实验室上海200092;

南方科技大学海洋科学与工程系深圳海洋地球古菌组学重点实验室广东深圳518055;

南方科技大学海洋科学与工程系深圳海洋地球古菌组学重点实验室广东深圳518055;

南方科技大学前沿与交叉科学研究院广东深圳518055;

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正文语种 chi
中图分类
关键词
海洋微生物多样性; 核糖体RNA; 测序技术;

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