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Y220C突变体影响p53C蛋白质构象转换的分子动力学模拟

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摘要

p53是迄今发现突变频率最高的一种肿瘤抑制蛋白质,突变会导致p53抑癌功能丧失并诱导癌症的发生.绝大多数的突变发生在p53的核心DNA结合区域(p53C),其中Y220C是研究较多的一种突变体.虽然已有研究表明该突变能够降低p53C的结构稳定性,但其影响p53C构象转换的分子机制尚不清晰.本文利用分子动力学(MD)模拟方法研究了p53C突变体Y220C (p53C-Y220C)的结构变化,发现Y220C突变主要影响Y220C cluster区域(包括残基138-164和215-238),且Y220C突变减少了Y220C cluster的β-折叠含量.进一步分析发现,Y220C突变不仅直接破坏突变氨基酸与周围氨基酸Leu145和Thr155之间的氢键,而且降低了Y220C cluster区域的折叠片S3和S8之间的氢键数量,使Y220C突变所形成的亲水性空腔变大,加速了水分子进入该蛋白质内部,并最终导致了p53C-Y220C变性.MD模拟结果揭示了Y220C突变影响p53C结构转换的分子机制,该研究对p53C-Y220C突变体高效稳定剂的筛选和设计具有重要意义.

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来源
《物理化学学报》 |2016年第10期|2620-2627|共8页
作者
沈洪辰; 丁吉勇; 李丽; 刘夫锋;
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作者单位

天津大学化工学院生物工程系,天津300072;

天津大学化工学院生物工程系,天津300072;

天津科技大学海洋与环境学院,天津300457;

天津大学化工学院生物工程系,天津300072;

天津科技大学生物工程学院,天津300457;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类结构化学;
关键词
癌症; p53; 残基突变; 构象转换; 分子动力学模拟;

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