分子动力学模拟方法研究结构水在糖原合成酶激酶-3β中的作用

孙浩; 蒋勇军; 俞庆森; 邹建卫

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分子动力学模拟方法研究结构水在糖原合成酶激酶-3β中的作用

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用分子动力学模拟的方法揭示了结构水分子在糖原合成酶激酶-3β(GSK-3β)中的作用.如果没有结构水,ATP嘌呤环的结合位置将发生偏移以填补结构水留下的空间;ATP结合口袋中的氢键网络将被破坏,保守残基Lys85与ATP的磷酸根侧链只能形成一个保守氢键,无法维持磷酸根转移所需的线性关系;由于失去了氢键网络的稳定作用,Glu97和Lys85会向远离ATP的方向移动,并导致Arg96的侧链发生偏转,使Arg96无法保持与Arg180和Lys205之间正常的相对位置,最终影响GSK-3β与底物的结合.

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来源
《物理化学学报》 |2009年第4期|635-639|共5页
作者
孙浩; 蒋勇军; 俞庆森; 邹建卫;
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作者单位

浙江大学化学系,杭州,310027;

浙江大学宁波理工学院分子设计与营养工程重点实验室,浙江,宁波,315100;

浙江大学化学系,杭州,310027;

浙江大学宁波理工学院分子设计与营养工程重点实验室,浙江,宁波,315100;

浙江大学宁波理工学院分子设计与营养工程重点实验室,浙江,宁波,315100;

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正文语种 chi
中图分类结构化学;
关键词
糖原合成酶激酶-3β; 结构水分子; 分子动力学模拟;

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