依据氨基酸残基的相关性预测蛋白质的结构类型

王树青; 刘红; 杜奇石; 魏冬青

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依据氨基酸残基的相关性预测蛋白质的结构类型

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作为蛋白质的建筑构件,各种类型的蛋白质的20种氨基酸残基之间存在着特定的相互关联,反映了氨基酸残基之间的制约性,并有深刻的物理和化学的内在因素.某些氨基酸残基对之间的相关系数可以作为一种类型的蛋白质区别于其它类型蛋白质的特征,用于蛋白质结构类型的预测.研究了4种类型的蛋白质204个样品的氨基酸残基对的相关性系数,找出了可作为蛋白质结构类型特征的氨基酸残基的相关对,并用于蛋白质结构类型的预测,对于α型、β型、α/β型和α+β型蛋白质的204个蛋白质样品的交叉测试,正确率分别为94%、89%、79%和89%,平均为88%,高于简单距离法和欧几里德距离法.

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来源
《物理化学学报》 |2004年第5期|498-502|共5页
作者
王树青; 刘红; 杜奇石; 魏冬青;
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作者单位

天津师范大学生物信息与药物开发研究所,天津,300074;

辽宁大学物理系,沈阳,110036;

天津师范大学生物信息与药物开发研究所,天津,300074;

天津师范大学生物信息与药物开发研究所,天津,300074;

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正文语种 chi
中图分类结构化学;蛋白质;
关键词
氨基酸相关性; 蛋白质结构预测; 生物信息学;

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