橡胶树EST-SSR标记开发及特性研究(英文)

李德军; 邓治; 郭会娜; 夏志辉

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橡胶树EST-SSR标记开发及特性研究(英文)

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为进一步开发橡胶树EST-SSR标记,该研究下载并组装了来自NCBI和马来西亚橡胶树EST数据库EST序列。在3 733个组装的橡胶树单一基因中共鉴定到566个潜在的SSR位点,平均3.96 kb会出现一个SSR位点。二核苷酸重复为最丰富的SSR重复类型,接下来是三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复。SSR位点重复单元数目最多的是5,接下来是12、6和7。在该研究中鉴定的51种类型SSR模体中,二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复分别有6、26、5、3和11种。GA/CT二核苷酸数目最多,接下来是TC/AG、AT/TA、CTT/GAA、TTC/AAG和TCT/AGA。在158个新开发的橡胶树EST-SSR标记中,99个可在橡胶树品种RRIM600中产生清晰扩增条带。该研究开发的EST-SSR标记丰富了橡胶树分子标记数量,必将在橡胶树DNA指纹图谱、遗传多样性、标记辅助选择、遗传图谱等方面得到广泛应用。

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来源
《农业科学与技术：英文版》 |2014年第5期|733-737|共5页
作者
李德军; 邓治; 郭会娜; 夏志辉;
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作者单位

中国热带农业科学院橡胶研究所;

海南大学农学院;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类农业科学;
关键词
橡胶树; 分子标记;

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