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首页> 中文期刊> 《生物技术通报》 >黄瓜二倍体及其同源四倍体果实转录组分析

黄瓜二倍体及其同源四倍体果实转录组分析

         
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摘要

果形和糖含量分别是与瓜类蔬菜作物外观、营养及风味密切相关的重要品质性状。为探究黄瓜倍性差异导致果形及糖含量变化的分子机制,以果形和糖含量差异显著的黄瓜二倍体(长果/低糖)和四倍体(短果/高糖)为试材,分别取开花当天和花后9 d的果实进行转录组分析。结果表明,在二、四倍体花后9 d果实中共鉴定到1874个差异表达基因(DEGs),其中上调基因818个和下调基因1056个;GO分析显示,DEGs显著富集在“DNA复制”(GO:0006260)、“DNA代谢过程”(GO:0006259)、“蛋白质复合体”(GO:0032993)、“染色体”(GO:0005694)、“蛋白质二聚活性”(GO:0046983)等GO条目上;KEGG分析表明,DEGs富集在“植物激素信号转导”(csv04075)、“淀粉与蔗糖代谢”(csv00500)等代谢通路上;参与“植物激素信号转导”相关基因AUX1、DELLA、B-ARR、TCH4上调表达,GH3、GID1、PP2C、CYCD3下调表达,以及参与“淀粉与蔗糖代谢”相关基因SPS、SUSY上调表达,可能与果形指数减小和果实糖含量增加有关。荧光定量PCR(RT-qPCR)分析显示,除ARF4外,所选定DEGs的表达模式与RNA-Seq中表达趋势相一致,其中SUSY在二、四倍体黄瓜果实中差异表达极显著,推测该基因在调控黄瓜四倍体果形及糖含量形成过程中起到重要作用。

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