家蝇泛素结合酶基因的生物信息学分析

国果; 吴沁怡; 吴建伟; 赵学军; 付萍; 张勇

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家蝇泛素结合酶基因的生物信息学分析

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利用EST测序技术从家蝇幼虫cDNA文库中获得家蝇泛素结合酶基因(MD-E2) cDNA序列,采用NCBI、ExPASY中的相关工具,对该基因及其编码蛋白的基本理化性质、疏水性、信号肽、二级结构和亚细胞定位等方面进行预测和分析,MEGA软件构建了进化树.结果表明,家蝇泛素结合酶基因的cDNA序列具有完整的ORF框,全长480 bp,一共编码159个氨基酸.其编码的蛋白质理论分子量为18.117 9 kD,等电点8.64,无信号肽及跨膜区,属于亲水性蛋白,具有泛素结合酶家族的活性位点(FHPNVYPSGTVCLSLL),主要分布于细胞核;二级结构以无规则卷曲为主,β折叠较少.

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来源
《生物技术通报》 |2014年第2期|107-111|共5页
作者
国果; 吴沁怡; 吴建伟; 赵学军; 付萍; 张勇;
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作者单位

贵阳医学院寄生虫学教研室,贵阳550004;

贵阳医学院寄生虫学教研室,贵阳550004;

贵阳医学院寄生虫学教研室,贵阳550004;

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贵阳医学院寄生虫学教研室,贵阳550004;

贵阳医学院寄生虫学教研室,贵阳550004;

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正文语种 chi
中图分类
关键词
家蝇; 泛素结合酶; 生物信息学;

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