基于条形码ITS2序列的青天葵及其混伪品分子鉴别

黄琼林; 马新业; 何瑞; 詹若挺; 陈蔚文

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基于条形码ITS2序列的青天葵及其混伪品分子鉴别

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通过分析青天葵及其常见混伪品的ITS2序列,建立青天葵新型真伪鉴别方法.采用植物基因组DNA提取试剂盒提取青天葵及其混伪品的叶片DNA,一对通用引物PCR扩增ITS2基因片段并直接双向测序.采用DNAMAN、ClustalX软件拼接比对序列,MEGA4.0软件构建NJ树,Schultz等建立的数据库和网站预测ITS2序列的二级结构.结果显示,获得的12条ITS2序列的长度范围为203-242 bp,GC含量范围为53.1％-71.8％.所有样品ITS2序列比对后的长度为249 bp,其中存在226个变异位点.青天葵种间K2P遗传距离(1.125)远大于种内K2P遗传距离(0.004).基于ITS2的序列的NJ树和二级结构均能直观地区分青天葵及其混伪品.

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来源
《生物技术通报》 |2012年第12期|173-179|共7页
作者
黄琼林; 马新业; 何瑞; 詹若挺; 陈蔚文;
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作者单位

广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心岭南中药资源教育部重点实验室,广州510006;

广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心岭南中药资源教育部重点实验室,广州510006;

广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心岭南中药资源教育部重点实验室,广州510006;

广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心岭南中药资源教育部重点实验室,广州510006;

广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心岭南中药资源教育部重点实验室,广州510006;

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正文语种 chi
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关键词
青天葵; ITS2混伪品; 分子鉴别;

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