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基于28S rDNA部分序列的石磺科系统发育研究

         

摘要

采用PCR技术对采集自中国大陆沿海5地8个群体石磺的28S rDNA部分序列进行扩增.将测序结果与GenBank中的另外3条石磺科贝类的对应序列一起,以小鼠28S rDNA基因序列进行参照,截取D1、D2、D3区域,拼接后进行比对分析.在获得的689 bp的序列中,有76个变异位点,28个简约信息位点,A+T平均含量为30.9%,C+G平均含量为69.0%.以分类关系较近的菊花螺科(Siphonaria alternate)为外群,用NJ、MP、ML和贝叶斯法构建分子系统树.4种方法得到的进化树拓扑结构很相似,得到的结果也与沈和定提出的中国大陆沿海石磺科贝类可划分为Peronia、Platevindex、Onchidium、Paraoncidium 4个属的观点基本一致.同时,28S rDNA部分序列的系统分析还显示,4个属中Peronia属与Paraoncidium属亲缘关系较近,Platevindex属与Onchidium属关系比较近.

著录项

  • 来源
    《生物技术通报》 |2010年第6期|172-178|共7页
  • 作者单位

    上海海洋大学水产与生命学院,上海,201306;

    上海海洋大学水产与生命学院,上海,201306;

    上海海洋大学水产与生命学院,上海,201306;

    上海海洋大学水产与生命学院,上海,201306;

    上海海洋大学水产与生命学院,上海,201306;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类
  • 关键词

    28S rDNA; D区; 石磺; 系统发育;

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