镉胁迫后旱柳转录组变化分析

曹继敏; 李双财; 何德

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镉胁迫后旱柳转录组变化分析

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随着重金属镉(Cd)应用范围的扩大,土壤Cd污染问题日益严重.以具有植物恢复潜力的旱柳(Saliz matsudana)作为研究对象,探究不同浓度的Cd胁迫后旱柳无性系1 d、7 d和30 d后基因表达与代谢通路的变化.转录组测序结果表明:共获得102595个Unigenes,相同浓度不同时间的差异基因总数为26623和32154个;相同时间不同浓度的差异基因总数为8550、3444和11428个.从中筛选得到与Cd胁迫响应密切相关的基因25个,其中金属硫蛋白、ABC转运蛋白、锌和锰转运蛋白等基因的表达不仅会随着Cd胁迫浓度变化而且同时受到胁迫时间的改变而发生改变;油菜素内酯合成通路的3,6-脱氧油菜素淄酮酶(ROT3)和黄酮类化合物合成通路的黄酮醇合成酶(FLS)、黄烷酮-3-羟化酶(F3H)均明显上调.此外旱柳响应Cd胁迫的GO条目主要集中在代谢过程、细胞过程、膜、细胞器、细胞、细胞部分、催化活化和结合蛋白上,参与这些GO条目的差异表达基因数随着Cd浓度和胁迫时间的增加而增加.通过转录组测序分析旱柳Cd胁迫后的响应机制,旨为旱柳修复土壤Cd污染提供理论指导.

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来源
《生物技术通报》 |2020年第7期|32-39|共8页
作者
曹继敏; 李双财; 何德;
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作者单位

西南林业大学生命科学学院昆明 650224;

西南林业大学生命科学学院昆明 650224;

西南林业大学生命科学学院昆明 650224;

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正文语种 chi
中图分类
关键词
旱柳; 镉; 转录组; 差异基因;

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