分子动力学模拟研究A1408G突变对核糖体16S rRNA片段的影响

董浩; 刘元宁

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分子动力学模拟研究A1408G突变对核糖体16S rRNA片段的影响

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利用分子动力学模拟方法, 研究了原核生物核糖体小亚基中的16S rRNA片段与氨基糖苷类抗生素巴龙霉素复合物结构的柔性. 结果表明, 16S rRNA片段中的1408位点的腺嘌呤(A)突变为鸟嘌呤(G), 改变了与tRNA中反密码子环识别相关的2个腺嘌呤A1492和A1493的空间构象, 阻碍了氨基糖苷类抗生素与核糖体的结合, 从而影响原核生物蛋白转录过程. 模拟结果与实验测定的晶体结构相吻合, 可为基于核糖体16S rRNA的药物分子设计提供较可靠的结构信息.

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来源
《高等学校化学学报》 |2010年第9期|1815-1819|共5页
作者
董浩; 刘元宁;
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作者单位

吉林大学计算机科学与技术学院,长春,132012;

吉林大学计算机科学与技术学院,长春,132012;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类结构化学;
关键词
核糖体; 16S rRNA A位点; 巴龙霉素; 分子动力学;

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