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南京市首例甲型H1N1(2009)流感病毒分离及其血凝素基因遗传变异分析

         

摘要

对南京市首例甲型H1N1(2009)病毒进行细胞分离,获得一株具有较高血凝活性的病毒,命名为A/Naniing/1/2009.在全基因组测序的基础上,时分离株的血凝素基因(haemagglutinin,HA)的遗传特征进行了详细研究.分离株HA蛋白不具有多碱基HA裂解位点,具有低致病性流感病毒特点.与参考株A/Califomia/04/2009相比,分离株A/Nanjing/1/2009 HA蛋白的有5个氨基酸发生了突变,其中一个位于Ca抗原位点208位氨基酸(R-K),这一突变虽然还不会影响抗原性的改变,但预示了新甲型H1N1(2009)抗原漂移的启动.分离株有5个潜在糖基化位点,这与近年来古典猪H1NI和北美三源重配猪H1病毒完全一致,保留了古典猪H1病毒的特点.与禽H1病毒相比,分离株HA蛋白受体结合位点上的190(E→D)和225(G→D)位点发生突变,这可能成为新甲型H1N1(2009)在人际间传播的一个重要分子基础.此外,其它受体结合位点上相关氨基酸同时具有人和猪流感病毒的特点.本研究对南京市早期流行的甲型H1N1(2009)流感病毒的HA蛋白的分子遗传特征进行了详细研究,对进一步监测病原变异具有重要指导意义.

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