一株Class Ⅰ新城疫病毒分离株NP和P蛋白基因分子特征和遗传进化分析

陈云霞; 刘华雷; 郑东霞; 赵云玲; 黄伟坚; 王志亮

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一株Class Ⅰ新城疫病毒分离株NP和P蛋白基因分子特征和遗传进化分析

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本研究对2009年实验室保存的一株Class Ⅰ新城疫病毒分离株NDV09-056的NP和P基因进行了扩增和序列分析,对其分子特征和遗传进化关系进行了分析.结果表明该分离株NP蛋白基因全长为1746nt,共编码489aa,其N端1～401孰基酸相对比较保守,C端402～479氛基酸变化比较大;同源性分析表明本分离株的NP蛋白基因与Ⅰ类新城疫病毒代表毒株之间核苷酸的同源性为93.5%～98.5%,而与Ⅱ类新城疫病毒代表毒株的同源性较低,介于77.0%～79.2%.P蛋白主要氛基酸突变区集中在57～107aa和135～212aa两个区域,而N端和C端相对保守;同源性分析表明本分离株的P蛋白基因与Ⅰ类新城疫病毒代表毒株之间核苷酸的同源性为90.4%～95.31%,而与Ⅱ类新城疫病毒代表毒株的同源性较低,介于68.3%～72.5%.遗传进化分析表明本分离株与I类基因3型新城疫病毒代表株NDV08-004的亲缘关系最近.

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来源
《中国动物检疫》 |2011年第3期|37-40|共4页
作者
陈云霞; 刘华雷; 郑东霞; 赵云玲; 黄伟坚; 王志亮;
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作者单位

中国动物卫生与流行病学中心,山东,青岛,266032;

广西大学动物科学学院,广西,南宁,530005;

中国动物卫生与流行病学中心,山东,青岛,266032;

中国动物卫生与流行病学中心,山东,青岛,266032;

中国动物卫生与流行病学中心,山东,青岛,266032;

广西大学动物科学学院,广西,南宁,530005;

中国动物卫生与流行病学中心,山东,青岛,266032;

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正文语种 chi
中图分类 S852.659.5;
关键词
新城疫病毒; Ⅰ类; NP基因; P基因;

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