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2014-2018年我国5株基因Ⅶ型新城疫病毒的基因组特性

         

摘要

cqvip:为了解我国基因Ⅶ型新城疫病毒的分子生物学特性,对2014-2018年分离的5株基因Ⅶ型新城疫病毒代表株进行了基因组测序和生物信息学分析。序列分析显示:5株病毒F蛋白裂解位点为112RRQKR/F117或112RRRKR/F117,具有强毒株的典型特征;病毒基因组长度均为15 192 nt,其F蛋白融合肽、七肽重复区和跨膜区,以及HN蛋白跨膜区、中和抗原表位等功能区有多处氨基酸变异。病毒F基因遗传进化分析显示:2014-2015年分离的2株病毒属于基因Ⅶ.1.1亚型;2016-2018年分离的3株病毒属于基因Ⅶ.2亚型,暗示此亚型毒株可能已逐步取代基因Ⅶ.1.1亚型,成为家禽中的优势流行毒株。本研究进一步掌握了我国基因Ⅶ型新城疫病毒的遗传特性,从而为科学防控该病提供了参考。

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