莲ARF基因家族全基因组鉴定和表达分析

苏静; 王柯阳; 董臣; 周江波; 李兰芝

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莲ARF基因家族全基因组鉴定和表达分析

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生长素反应因子(auxin response factor,ARF)是调节生长素表达的转录因子响应基因,与植物生长发育和信号转导等多个过程密切相关.本研究对莲ARF基因家族进行鉴定,从莲的全基因组中共鉴定到30个ARF基因家族成员.分析其理化性质发现它们的氨基酸数介于86aa～988aa,等电点范围为4.61～9.05,大部分表现为酸性且都为亲水蛋白.利用生物信息学软件分析莲的ARF蛋白序列的保守结构域和保守基序,结果显示莲中不是所有的ARF蛋白都含有B3结构域、Auxin_resp结构域、AUX_IAA结构域,但至少具备其中一种结构域,ARF基因家族中预测含有15个保守基序,对莲ARF保守域蛋白序列进行进化树分析,莲中ARF蛋白可以被划分为四组,基因结构进化高度保守.研究结果为后续深入研究莲ARF基因家族的功能奠定了基础.

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来源
《南方农机》 |2020年第15期|9-13|共5页
作者
苏静; 王柯阳; 董臣; 周江波; 李兰芝;
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作者单位

湖南农业大学湖南省农业大数据分析与决策工程技术研究中心湖南长沙410128;

湖南农业大学湖南省农业大数据分析与决策工程技术研究中心湖南长沙410128;

河南工业大学生物工程学院河南郑州450001;

贵州省凯里学院大健康学院贵州凯里556011;

湖南农业大学湖南省农业大数据分析与决策工程技术研究中心湖南长沙410128;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类植物激素;
关键词
莲; ARF基因家族; 基因表达; 生物信息分析;

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