基于癌症基因组图谱数据库探索miR-217在胃癌中的表达及其预后价值

郑侠; 邵杰; 谷雨; 潘宇

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基于癌症基因组图谱数据库探索miR-217在胃癌中的表达及其预后价值

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目的评估miR-217在胃癌组织中的表达及其预后价值。方法利用R语言统计学软件下载癌症基因组图谱数据库(TCGA)胃癌数据集中患者的临床病理学资料、生存数据和miRNA测序数据,比较miR-217在肿瘤组织与癌旁组织间的表达差异,受试者操作特征曲线(ROC)评估miR-217对胃癌的诊断价值;Kaplan-Meier生存分析比较不同miR-217表达水平的胃癌患者无进展时间(PFI)和总生存期(OS);利用单因素和多因素Cox回归分析评估影响PFI和OS的预后因子;利用基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)对miR-217潜在靶基因进行功能和信号通路富集分析。结果446例胃癌患者纳入分析,Wilcoxon秩和检验结果显示,miR-217显著高表达于胃癌组织(5.10 vs.3.74,P0.05)。GO/KEGG富集分析结果表明,miR-217潜在的靶基因主要富集于前列腺癌、膀胱癌、黑色素瘤、子宫内膜癌、EGFR酪氨酸激酶抑制剂抵抗、细胞间蛋白转运调节、蛋白入核调节、神经分支形态、成长发育负向调节及核-浆转运调控等病理过程。结论miR-217显著高表达于胃癌组织,其表达水平可用于预测胃癌患者的死亡风险;miR-217的生物学功能可能与泌尿生殖系统恶性肿瘤以及蛋白质转运等相关。

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来源
《临床肿瘤学杂志》 |2022年第9期|788-793|共6页
作者
郑侠; 邵杰; 谷雨; 潘宇;
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作者单位

江苏省中医院南京中医药大学附属医院肿瘤科;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类胃肿瘤;
关键词
胃癌; miR-217; 预后因子; 癌症基因组图谱数据库;

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