中国草原红牛PDK4基因克隆及其组织表达差异性研究

马彦茹; 于永生; 肖成; 曹阳; 秦立红; 赵玉民; 吴健

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为研究中国草原红牛丙酮酸脱氢酶激酶4(Pyruvate Dehydrogenase Kinase 4,PDK4)基因功能,本研究克隆了PDK4基因编码区序列(CDS),从mRNA水平检测PDK4基因在中国草原红牛各组织及其前体脂肪细胞成脂分化过程中的表达差异,最后进行生物信息学分析。根据NCBI公布的牛PDK4基因序列(登录号:NM_001101883.1)设计引物,PCR扩增和克隆测序,获得草原红牛PDK4基因完整CDS序列,应用生物信息学软件分析蛋白理化性质和结构,预测蛋白信号肽和磷酸化位点及构建系统进化树;通过实时荧光定量PCR检测PDK4基因在中国草原红牛各组织中mRNA的相对表达量及PDK4基因在前体脂肪细胞分化过程中mRNA水平上的表达情况。结果显示:本研究成功获得中国草原红牛PDK4基因CDS序列,长度为1223bp,编码407个氨基酸,与野牦牛同源性较高(99.8%),与埃及果蝠的同源性较低(89.7%)。PDK4基因在草原红牛心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胃、十二指肠、背最长肌和脂肪中均显著表达,其中在背最长肌中的表达量显著高于其他组织。成脂分化结果表明,PDK4基因mRNA表达量在0~4 d呈上升趋势,4^(6) d之间无显著差异。

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来源
《中国畜牧杂志》 |2022年第10期|191-197|共7页
作者
马彦茹; 于永生; 肖成; 曹阳; 秦立红; 赵玉民; 吴健;
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作者单位

吉林农业大学动物科学技术学院;

吉林省农业科学院;

农业农村部肉牛遗传育种重点实验室;

农业农村部东北种牛性能测定中心;

吉林省肉牛繁育及养殖技术科技创新中心;

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正文语种 chi
中图分类 S823.2;
关键词
草原红牛; PDK4基因; 生物信息学分析; 实时荧光定量PCR;

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