高通量测序技术分析青海藏羊初乳和常乳微生物多样性

张莉莉; 崔占鸿; 孙璐; 刘书杰

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高通量测序技术分析青海藏羊初乳和常乳微生物多样性

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为探究藏羊初乳和常乳的微生物组成及多样性,本试验选取体况良好、2~3胎次的藏羊6头,采集初乳(C)和常乳(OM)。基于高通量测序技术对2组乳样的16S rDNA的V4区进行分析,选用PICRUSt进行功能预测。结果显示:97%的一致性共得到3413个OTUs,微生物Alpha多样性指数在藏羊常乳中高于藏羊初乳(P<0.05)。变形菌门(Proteobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes)是2组乳样中丰度最高的2种菌门,藏羊初乳中2种菌门丰富度分别为77.61%和11.66%,常乳中为71.65%和17.43%。在属水平上,2组乳样的优势菌属均为假单胞菌属(Pseudomonas)、丛毛单胞菌属(Comamonas),且藏羊初乳中假单胞菌属和乳杆菌属(Lactobacillus)丰度高于常乳。16S rDNA基因KEGG水平功能预测,结果发现常乳在遗传信息处理、复制修复和翻译功能上得到显著富集,初乳在氨基酸代谢功能上得到显著富集。表明藏羊初乳和常乳微生物多样性存在显著差异,并发现常乳在遗传信息处理、复制修复和翻译功能上得到显著富集,初乳在氨基酸代谢功能上得到显著富集。

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来源
《中国畜牧杂志》 |2023年第5期|129-135|共7页
作者
张莉莉; 崔占鸿; 孙璐; 刘书杰;
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作者单位

青海大学畜牧兽医科学院;

农业农村部青藏高原放牧牦牛藏羊动物营养与饲草料重点实验室;

青海省牦牛工程技术研究中心;

青海省高原放牧家畜动物营养与饲料科学重点实验室;

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正文语种 chi
中图分类 S826.2;
关键词
藏羊; 初乳; 常乳; 微生物多样性; 功能预测;

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