碱地黑牛FADS1基因克隆测序及表达分析

陈振鹏; 刘瑞莉; 王胜; 韩明轩; 于堃; 张文琦; 柏学进; 董雅娟

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实验旨在研究碱地黑牛脂肪酸脱氢酶1基因(FADS1)CDS区序列和表达情况,并探讨FADS1基因理化性质及表达规律。本研究通过克隆测序构建FADS1的系统进化树并进行生物信息学分析,用免疫组化技术对FADS1蛋白进行定位分析,免疫印迹检测FADS1蛋白在实验组织的表达情况。生物信息学结果显示碱地黑牛FADS1 CDS区长1083 bp,编码360个氨基酸。FADS1不存在信号肽。FADS1进化树显示碱地黑牛FADS1与牛的遗传距离较近(99.9%),与鸡的遗传距离较远(80.0%)。结构预测表明FADS1中α螺旋占48.61%,β折叠占3.61%,延长链占13.06%,无规则卷曲占34.72%,4个α螺旋构成四螺旋束并在螺旋肽段之间形成一个疏水性的空腔,整体呈中空的桶状。互作网络解析显示:FADS1与ACSL1、ACSL3、ELOVL2、ELOVL5、PTPLA、PTPLB、ACOX1、ACOX2、ACADM、FASN、TECR等蛋白互作,参与FADS1-ELOVL5-HSD17B12-ACADM-ACOX1、FADS1-FASN-ACADVL-ACOX2等脂肪酸合成、代谢、脂滴生成相关过程的调控网络。亚细胞定位预测表明:FADS1在内质网、线粒体及分泌系统小泡中表达。免疫组化显示FADS1于胞内细胞器表达明显,局限性的分布在胞膜一侧。荧光定量及免疫印迹显示肝中丰度最高(P<0.01),心脏次之,脂肪最低。综上推测,FADS1基因参与促进碱地黑牛肝脏脂肪酸合成过程,对调控脂质代谢、沉积发挥着重要作用。

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来源
《中国畜牧杂志》 |2023年第5期|92-98|共7页
作者
陈振鹏; 刘瑞莉; 王胜; 韩明轩; 于堃; 张文琦; 柏学进; 董雅娟;
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作者单位

青岛农业大学动物科技学院;

黑牛种业技术创新中心;

山东胜伟牧业有限公司;

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正文语种 chi
中图分类 S823.2;
关键词
FADS1基因; 生物信息学; 碱地黑牛; 免疫组化; 免疫印迹;

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