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贵州本地山羊JAK2基因5’调控区SNP生物信息学分析

         

摘要

本实验旨在从贵州本地山羊JA K2基因启动子区查找SNP,并分析其在启动子区中的作用.以贵州当地优良品种贵州白山羊、贵州黑山羊及黔北麻羊3种山羊构建不同DNA池,双向测序筛选SNP位点,降低测序误差.结果表明:JAK2基因5’调控区存在5个SNPs位点,分别为G-278C、G-275C、C-265G、A-193G和G-43T;各生物信息学在线软件预测获得JAK2基因核心启动子范围及CpG岛位置,单核苷酸多态性位点导致附近大量转录因子新位点产生和原来结合位点消失,但并不改变CpG岛大小.结果提示,JAK2基因5’调控区存在5个对启动子功能元件有较大影响的SNP位点,该结果为进一步了解JAK2基因启动子区功能元件奠定基础.

著录项

  • 来源
    《中国畜牧杂志》 |2014年第15期|1-5|共5页
  • 作者单位

    贵州大学动物科学学院,贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,贵州贵阳550025;

    贵州大学动物科学学院,贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,贵州贵阳550025;

    贵州大学动物科学学院,贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,贵州贵阳550025;

    贵州省畜牧技术推广站,贵州贵阳550001;

    贵州省畜牧技术推广站,贵州贵阳550001;

    贵州大学动物科学学院,贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,贵州贵阳550025;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 S827.2;
  • 关键词

    JAK2; SNP; 启动子; 贵州白山羊; 贵州黑山羊; 黔北麻羊;

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