兰坪乌骨绵羊PDGFRL基因编码区序列扩增及其生物信息学分析

彭超超; 刘兴能; 岳丹; 朱俊红; 熊和丽; 李静; 和晓明; 席冬梅; 邓卫东

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本研究根据Genbank载入的普通绵羊血小板衍生生长因子受体样蛋白(PDGFRL)基因序列设计特异性引物.利用PCR技术扩增乌骨绵羊PDGFRL基因编码区片段,经测序后对序列进行比对分析,并采用生物信息学软件对编码区序列和蛋白质结构进行预测.结果表明:兰坪乌骨绵羊PDGFRL基因编码区序列全长1128 bp,编码375个氨基酸;同普通绵羊进行核苷酸序列同源性比对发现同源性为99.73％,发现3个碱基同义突变;生物信息学分析表明不同物种PDGFRL基因编码区核苷酸序列与氨基酸序列具有较高的保守性;蛋白结构预测显示,PDGFRL蛋白空间结构主要由α螺旋、β折叠和无规则卷曲构成.

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来源
《中国畜牧杂志》 |2020年第10期|150-155|共6页
作者
彭超超; 刘兴能; 岳丹; 朱俊红; 熊和丽; 李静; 和晓明; 席冬梅; 邓卫东;
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作者单位

云南农业大学动物科学技术学院云南昆明 650201;

云南农业大学动物科学技术学院云南昆明 650201;

云南农业大学动物科学技术学院云南昆明 650201;

云南农业大学动物科学技术学院云南昆明 650201;

云南农业大学动物科学技术学院云南昆明 650201;

云南省畜牧兽医科学院云南昆明 650201;

云南农业大学动物科学技术学院云南昆明 650201;

公安部昆明警犬基地云南昆明 650201;

云南农业大学动物科学技术学院云南昆明 650201;

云南农业大学动物科学技术学院云南昆明 650201;

云南农业大学动物科学技术学院云南昆明 650201;

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正文语种 chi
中图分类 S826.2;
关键词
乌骨绵羊; PCR扩增; PDGFRL基因; 蛋白质结构预测;

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