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4个发育期香猪睾丸中piRNA簇的生物信息学分析

         
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摘要

为明确piRNA簇(Piwi-interactiing RNA Clusters)在香猪睾丸发育过程中的表达规律和调节作用,本实验选择4个发育期的雄性香猪12头:断奶期(2月龄)、初情期(3月龄)、性成熟期(6月龄)和体成熟期(12月龄),构建了4个小RNA文库,经小RNA测序,研究睾丸piRNA簇的数量、分布、来源、功能以及表达规律.结果 显示:从4个发育期睾丸组织中共发现了758个piRNA簇,其中198个簇2个及2个以上发育期共表达.piRNA簇在染色体上的分布不均匀,6号、14号染色体最为密集,Y染色体上没有检测到piRNA簇.4个发育期香猪睾丸中58％以上的piRNA簇处于低丰度表达(CPM<1),转座因子(TE)衍生的piRNA簇比例随月龄增加而下降,cDNA里检测到的piRNA簇保持较高数量.对piRNA簇来源基因进行GO分析,发现主要富集于binding功能,从中发现3个piRNA簇(簇Clu-003、簇Clu-033和簇Clu-025)与精子发生相关.这些研究结果提示piRNA簇影响香猪睾丸的发育过程.

著录项

  • 来源
    《中国畜牧杂志》 |2020年第10期|141-150|共10页
  • 作者

    马鑫芮; 冉雪琴; 牛熙; 黄世会; 王嘉福;

  • 作者单位

    贵州大学生命科学学院/山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室 贵州贵阳 550025;

    贵州大学动物科学学院 贵州贵阳 550025;

    贵州大学生命科学学院/山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室 贵州贵阳 550025;

    贵州大学动物科学学院 贵州贵阳 550025;

    贵州大学生命科学学院/山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室 贵州贵阳 550025;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 S828.3;
  • 关键词

    香猪; piRNA簇; 睾丸; 发育机制;

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